RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	RGS19	P49795	217 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ACTBL2	Q562R1	376 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM17	Q86X19	198 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	REEP6	Q96HR9	211 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SGCZ	Q96LD1	299 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CDC6	Q99741	560 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PADI1	Q9ULC6	663 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SFT2D2	O95562	160 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINA5	P05154	406 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	HOXB5	P09067	269 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF32	P17041	273 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CPT2	P23786	658 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	B2M	P61769	119 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H3A	P68431	136 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FAM189A2	Q15884	450 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	AAED1	Q7RTV5	226 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0B4J2A0	478 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	GJE1	A6NN92	205 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152		H0YIZ8	118 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FPR2	P25090	351 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	HTR5A	P47898	357 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	RRAD	P55042	308 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	BATF2	Q8N1L9	274 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OR10D3	Q8NH80	312 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ABHD3	Q8WU67	409 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	MARC2	Q969Z3	335 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	RNF126	Q9BV68	326 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	DEPP	Q9NTK1	212 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	GHRL	Q9UBU3	117 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SRD5A2	P31213	254 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CBX5	P45973	191 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	GGN	Q86UU5	652 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OR10C1	Q96KK4	312 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	GDF1	P27539	372 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OPRM1	P35372	400 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R46	P59540	309 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PDCD1	Q15116	288 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	RSU1	Q15404	277 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SPINK14	Q6IE38	97 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	DYRK2	Q92630	601 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	GUCD1	Q96NT3	240 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	FAM221A	A4D161	298 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	PINLYP	A6NC86	204 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	MSGN1	A6NI15	193 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINE3	A8MV23	424 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	SYNGR3	O43761	229 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	APOC1	P02654	83 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	CRYGS	P22914	178 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	ALDH3B1	P43353	468 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	AKR1C2	P52895	323 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BRF1-222	ENST00000635152	AKR1C1	Q04828	323 aa		11.41	□□□□□ -0.58

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