RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627212.2

RAPGEF6-215, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 4,694 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q7L0L9 218 aa8.9□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.9□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 COMMD1Q8N668 190 aa8.9□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 MVB12AQ96EY5 273 aa8.9□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 SCMH1Q96GD3 660 aa8.9□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 BTF3L4Q96K17 158 aa8.9□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa8.9□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 FOXB1Q99853 325 aa8.9□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A1W2PNV4 684 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 SH2D1BO14796 132 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 GABRA1P14867 456 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 COL9A1P20849 921 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 GSK3AP49840 483 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC25A1P53007 311 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 UBE2G1P62253 170 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 GNB1P62873 340 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 PSG6Q00889 435 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 MGAT2Q10469 447 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF774Q6NX45 483 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 WDR34Q96EX3 536 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 MFRPQ9BY79 579 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 NMES1Q9C002 83 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.9□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 LMO7DNF2Z398 122 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 SOCS1O15524 211 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 FCER1GP30273 86 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 THBS3P49746 956 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 GZMMP51124 257 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 TIGITQ495A1 244 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 DRAM2Q6UX65 266 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM178AQ8NBL3 297 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 NUDT19A8MXV4 375 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR5AC1P0C628 307 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CT45A6P0DMU7 189 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CT45A5P0DMU8 189 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CT45A7P0DMV0 189 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CT45A8P0DMV1 189 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CT45A9P0DMV2 189 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 FUT3P21217 361 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 EFNB2P52799 333 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 FZD2Q14332 565 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF573Q86YE8 665 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR6S1Q8NH40 331 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR1L3Q8NH93 324 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 MSL2Q9HCI7 577 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 OPN4Q9UHM6 478 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 ADAM20O43506 726 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 TBX19O60806 448 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CST4P01036 141 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CLEC3BP05452 202 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPRED2Q7Z698 418 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CA10Q9NS85 328 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A1W2PR64 198 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A1W2PRV1 198 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 COX5AP20674 150 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 RAG2P55895 527 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM33P57088 247 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 RAB1AP62820 205 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR2A2Q6IF42 318 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 TRIB1Q96RU8 372 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 DECR2Q9NUI1 292 aa8.89□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 TUBAL3A6NHL2 446 aa8.88□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC31A2O15432 143 aa8.88□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF32P17041 273 aa8.88□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 FGF7P21781 194 aa8.88□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 DTYMKP23919 212 aa8.88□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 BTNL8Q6UX41 500 aa8.88□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.88□□□□□ -0.99
RAPGEF6-215ENST00000627212 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms