RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	AQP4	P55087	323 aa		18.79	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		18.79	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		18.79	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		18.79	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	GGH	Q92820	318 aa		18.79	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	CHST5	Q9GZS9	411 aa		18.79	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		18.79	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	C3orf80	F5H4A9	247 aa		18.78	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	GNB2	P62879	340 aa		18.78	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	LCN2	P80188	198 aa		18.78	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		18.78	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	RDH10	Q8IZV5	341 aa		18.78	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	GPR173	Q9NS66	373 aa		18.78	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		18.78	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		18.78	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		18.78	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	RNF212B	A8MTL3	300 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	CD80	P33681	288 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	PITPNB	P48739	271 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	ETV1	P50549	477 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	ST3GAL4	Q11206	333 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	UTS2B	Q765I0	119 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	OR52N1	Q8NH53	320 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	RASL12	Q9NYN1	266 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	CLN8	Q9UBY8	286 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
APBA3-208	ENST00000592826	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	ATP6V1G2	O95670	118 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF20	P17024	532 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	SRD5A1	P18405	259 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	FUT6	P51993	359 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	CD276	Q5ZPR3	534 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	AQP3	Q92482	292 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	NEK6	Q9HC98	313 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		18.76	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		18.75	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826		A6NIN4	97 aa		18.75	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	HAAO	P46952	286 aa		18.75	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	SCGB2A2	Q13296	93 aa		18.75	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		18.75	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		18.75	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	STX19	Q8N4C7	294 aa		18.75	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		18.75	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	PKIB	Q9C010	78 aa		18.75	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	SCN3B	Q9NY72	215 aa		18.75	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826		J3QT63	122 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	ADAM20	O43506	726 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	ZFPL1	O95159	310 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	GYPA	P02724	150 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	EGR1	P18146	543 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	PRKACB	P22694	351 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	GLRA1	P23415	457 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	UBE2V2	Q15819	145 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	FGGY	Q96C11	551 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		18.74	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826		E9PI62	339 aa		18.73	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	GPR37	O15354	613 aa		18.73	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	AKR7A2	O43488	359 aa		18.73	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	XPNPEP2	O43895	674 aa		18.73	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	ALX3	O95076	343 aa		18.73	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	MYF6	P23409	242 aa		18.73	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	MPZ	P25189	248 aa		18.73	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	RNLS	Q5VYX0	342 aa		18.73	■□□□□ 0.59
APBA3-208	ENST00000592826	MYDGF	Q969H8	173 aa		18.73	■□□□□ 0.59

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