RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 CHID1Q9BWS9 393 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 MUC13Q9H3R2 512 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1W2PPE2 198 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1W2PR64 198 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1W2PRV1 198 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 ACOD1A6NK06 481 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 OR2AT4A6NND4 320 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 NUDT19A8MXV4 375 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 AKR7A2O43488 359 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 SYNGR1O43759 233 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF682O95780 498 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 CHRM2P08172 466 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 LMO1P25800 156 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 PEX2P28328 305 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 OMPP47874 163 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 CAPZA1P52907 286 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 FXYD6P3P58550 94 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 BLCAPP62952 87 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 MXRA7P84157 204 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 FAM3AP98173 230 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 IL5RAQ01344 420 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 SPIBQ01892 262 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 TIGD6Q17RP2 521 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 IFI44LQ53G44 452 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 FAM209BQ5JX69 171 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 AGBL2Q5U5Z8 902 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZS46 218 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 OR2T12Q8NG77 320 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 OR5K1Q8NHB7 308 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 SPSB4Q96A44 273 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 ATP6V0BQ99437 205 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 KCNJ15Q99712 375 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 SPXQ9BT56 116 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 PARD6BQ9BYG5 372 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 FN3KQ9H479 309 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 CENPMQ9NSP4 180 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 NLKQ9UBE8 527 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-210ENST00000578916 OR6C68A6NDL8 312 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM210A6NLX4 147 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 H3BUI4 141 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 FXYD1O00168 92 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PRODHO43272 600 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 RHBDL1O75783 438 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 GLRA1P23415 457 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SLC6A6P31641 620 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ERVFRD-1P60508 538 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CBX3Q13185 183 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 RIPK1Q13546 671 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SNCBQ16143 134 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 FGD3Q5JSP0 725 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CEP78Q5JTW2 689 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 FANK1Q8TC84 345 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 MYDGFQ969H8 173 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 TLCD1Q96CP7 247 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 MALSU1Q96EH3 234 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 REEP6Q96HR9 211 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 IFT27Q9BW83 186 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 TVP23AA6NH52 213 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 MRASO14807 208 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ARPC3O15145 178 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 ARG1P05089 322 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 CFL1P23528 166 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-210ENST00000578916 PYCR1P32322 319 aa7.32□□□□□ -1.24
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