RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TEX29Q8N6K0 151 aa6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 MRI1Q9BV20 369 aa6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CLN8Q9UBY8 286 aa6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.51□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 J3QLI3 93 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 FSTL3O95633 263 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 IGLV3-1P01715 115 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 IGHA1P01876 353 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 GNAO1P09471 354 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 WNT2P09544 360 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CCDC159P0C7I6 412 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 GLRA1P23415 457 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 GATA3P23771 443 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CPT2P23786 658 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 HAAOP46952 286 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 AQP4P55087 323 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ISL1P61371 349 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 SCGB2A2Q13296 93 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 RDH10Q8IZV5 341 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 STX19Q8N4C7 294 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 NRG4Q8WWG1 115 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 PELI1Q96FA3 418 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 BORCS8Q96FH0 119 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TMEM80Q96HE8 168 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 HHLA2Q9UM44 414 aa6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 VWFP04275 2813 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TMEM212A6NML5 194 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 SRRM5B3KS81 715 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 MYL12BO14950 172 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TMPRSS2O15393 492 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 NDUFB3O43676 98 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 XPNPEP2O43895 674 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 RHBDL1O75783 438 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 INMTO95050 263 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CYB5AP00167 134 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 PLATP00750 562 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 LHBP01229 141 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CCL1P22362 96 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 GABRA2P47869 451 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 HSPA13P48723 471 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 NPY4RP50391 375 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ETV1P50549 477 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CCR9P51686 369 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ST3GAL4Q11206 333 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 MIDNQ504T8 468 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CD276Q5ZPR3 534 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 FDX2Q6P4F2 183 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 AHSA2Q719I0 299 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 PP6455Q8WZ26 134 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ST8SIA4Q92187 359 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 AQP3Q92482 292 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 GGHQ92820 318 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 FGGYQ96C11 551 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms