RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANGPTL7O43827 346 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD3EP07766 207 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF250P15622 560 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 SERPINA2P20848 420 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 HAAOP46952 286 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 SELENOVP59797 346 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZP1P60852 638 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAM5Q6NVV9 412 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR8H2Q8N162 312 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUP37Q8NFH4 326 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 MICU1Q9BPX6 476 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYT3Q9BQG1 590 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 DIABLOQ9NR28 239 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 GHRLQ9UBU3 117 aa14.72□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0G2JMP0 313 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0X1KG70 313 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 C19orf84I3L1E1 186 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 LDLRAD4O15165 306 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CTAG2O75638 210 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 MPIG6BO95866 241 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 NAT2P11245 290 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDK2P24941 298 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNG3P63215 75 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 UNC119Q13432 240 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 RSU1Q15404 277 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 MSMPQ1L6U9 139 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CALHM1Q8IU99 346 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR4M2Q8NGB6 313 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM222BQ8WU58 562 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 SOSTQ9BQB4 213 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 SRRQ9GZT4 340 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CST11Q9H112 138 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 METTL9Q9H1A3 318 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 BANF2Q9H503 90 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 MSL2Q9HCI7 577 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CA10Q9NS85 328 aa14.71□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR5B21A6NL26 309 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 H0YL77 283 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF224P0DH78 156 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGFBP2P18065 325 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAB6AP20340 208 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF611Q8N823 705 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR51F2Q8NH61 342 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTX4Q96A99 478 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC22A4Q9H015 551 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1W2PP11 408 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 HTR3BO95264 441 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGHV3-13P01766 116 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALDH3B1P43353 468 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 QRFPP83859 136 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 PITPNAQ00169 270 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC25A26Q70HW3 274 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF573Q86YE8 665 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM104Q8NE00 496 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 C14orf119Q9NWQ9 140 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.7□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLSCR5A0PG75 271 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 VSTM5A8MXK1 200 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDC14BO60729 498 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 KDM4BO94953 1096 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYB5AP00167 134 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 NR4A2P43354 598 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q8N402 240 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACBD4Q8NC06 268 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC32Q9BV29 185 aa14.69□□□□□ -0.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms