RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552440.5

USP44-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, human

TSL 5 BASIC

Gene USP44, Length 1,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP44-208	ENST00000552440	ZNF225	Q9UK10	706 aa		3.38	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	CACNA1F	O60840	1977 aa		3.38	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		3.38	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		3.38	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		3.38	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440		A0A0G2JLM5	398 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	SYCE1L	A8MT33	242 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	PLIN3	O60664	434 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	TTC4	O95801	387 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	TSHB	P01222	138 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	HSD17B1	P14061	328 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	SELE	P16581	610 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	PRKACG	P22612	351 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ANOS1	P23352	680 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	F2R	P25116	425 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	SLC35A1	P78382	337 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	PYCR3	Q53H96	274 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440		Q6ZN92	141 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	SKA3	Q8IX90	412 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ASB13	Q8WXK3	278 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	TSC22D3	Q99576	134 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ARV1	Q9H2C2	271 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	MOK	Q9UQ07	419 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	CEP350	Q5VT06	3117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	EP400	Q96L91	3159 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ARHGEF10	O15013	1369 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	OR6C6	A6NF89	314 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	MSGN1	A6NI15	193 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	METTL15	A6NJ78	407 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	C15orf61	A6NNL5	157 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	MFNG	O00587	321 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	PHYH	O14832	338 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	SLC31A2	O15432	143 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	GLUD1	P00367	558 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	EDN1	P05305	212 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	CD37	P11049	281 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	PSG1	P11464	419 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	CHRNB4	P30926	498 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	SNAP25	P60880	206 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	BTN3A2	P78410	334 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	MS4A2	Q01362	244 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	GINS1	Q14691	196 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	LIN52	Q52LA3	116 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ZNF774	Q6NX45	483 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ZNF790	Q6PG37	636 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	COMMD7	Q86VX2	200 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ZNF561	Q8N587	486 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	TMED9	Q9BVK6	235 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	OR51I1	Q9H343	314 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		3.37	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	ABCC1	P33527	1531 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	MIA2	Q96PC5	1412 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
USP44-208	ENST00000552440		E9PLD3	99 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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