RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CEACAM5P06731 702 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ELK1P19419 428 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CEACAM3P40198 252 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GABRA4P48169 554 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CRYBA4P53673 196 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 HERV-K104P61576 105 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF101Q8IZC7 436 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 LILRA2Q8N149 483 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SPICQ8N5J4 248 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 MRGPRFQ96AM1 343 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SNX22Q96L94 193 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SYT3Q9BQG1 590 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF337Q9Y3M9 751 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 E5RGE8 158 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PPP6CO00743 305 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ICOSLGO75144 302 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR5H8P0DN80 308 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FPR2P25090 351 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OPRM1P35372 400 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CDKN2DP55273 166 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 LGALS4P56470 323 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CLDN18P56856 261 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GPNMBQ14956 572 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 MESTQ5EB52 335 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR4K5Q8NGD3 323 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ADOQ96SZ5 270 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CHST8Q9H2A9 424 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 WDR54Q9H977 334 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 P4HTMQ9NXG6 502 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf98E9PRG8 122 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CA2P00918 260 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CTXN2P0C2S0 81 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZGLP1P0C6A0 271 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SSTR5P35346 364 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SSX1Q16384 188 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RHBDD2Q6NTF9 364 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GUSBP11Q6P575 273 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GALNT16Q8N428 558 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SUMF1Q8NBK3 374 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS33Q8NF86 280 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR52B6Q8NGF0 335 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR1P1Q8NH06 330 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ASIC5Q9NY37 505 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PLXNB2O15031 1838 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM189A5PLL7 270 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FAM183AA6NL82 134 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 DEGS1O15121 323 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 IGF2P01344 180 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CD14P08571 375 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 EPXP11678 715 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PNLIPRP2P54317 469 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SELENOWP63302 87 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR6T1Q8NGN1 323 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM106AQ96A25 262 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF75AQ96N20 296 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR51I2Q9H344 312 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM202A6NGA9 273 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ISLRO14498 428 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TNFSF12O43508 249 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ADRA2AP08913 450 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PGAM2P15259 253 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 AKR1C4P17516 323 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SRMP19623 302 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 IL2RGP31785 369 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 LIPAP38571 399 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PPICP45877 212 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RGRP47804 291 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CTXN1P60606 82 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PFN3P60673 137 aa5.65□□□□□ -1.5
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