RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	HPS1	Q92902	700 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ERGIC1	Q969X5	290 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1B0GWJ7	208 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	SMIM30	A4D0T7	59 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM64B	A6NI03	449 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC30	A6NM36	301 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	NOTO	A8MTQ0	251 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658		H3BMQ9	156 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658		J3QT63	122 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CD8A	P01732	235 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM225B	P0DP42	221 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF154	Q13106	437 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	MAB21L1	Q13394	359 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	RAB11B	Q15907	218 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	AWAT2	Q6E213	333 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	MKX	Q8IYA7	352 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	COL12A1	Q99715	3063 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SHISA3	A0PJX4	238 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	IFNL4	K9M1U5	179 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	DNASE1	P24855	282 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	HTR2C	P28335	458 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	RORC	P51449	518 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CAPZA1	P52907	286 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	RIN1	Q13671	783 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	HFE	Q30201	348 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	NDNF	Q8TB73	568 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PKIB	Q9C010	78 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	METTL9	Q9H1A3	318 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SLC17A2	O00624	439 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CDIPT	O14735	213 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	NCR1	O76036	304 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	UBB	P0CG47	229 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ADRA2C	P18825	462 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	GATA4	P43694	442 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	OR3A4P	P47883	348 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	OR10A3	P58181	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	IL24	Q13007	206 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	GPR176	Q14439	515 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SPCS2	Q15005	226 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	RSU1	Q15404	277 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	IDNK	Q5T6J7	187 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	HES5	Q5TA89	166 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658		Q8IYB0	196 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	AQP3	Q92482	292 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	AP3S1	Q92572	193 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SLAMF9	Q96A28	289 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	OR51I2	Q9H344	312 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	IFITM5	A6NNB3	132 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	AIP	O00170	330 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CDC14B	O60729	498 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM127	O75204	238 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8

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