RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	TCF19	Q9Y242	345 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	OR2AT4	A6NND4	320 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	NME4	O00746	187 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	XRCC2	O43543	280 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	ANGPTL7	O43827	346 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	HLA-DQA2	P01906	255 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	SMIM18	P0DKX4	95 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	PSG2	P11465	335 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF823	P16415	610 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	FAH	P16930	419 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	NDUFB7	P17568	137 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	CD33	P20138	364 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	ACKR3	P25106	362 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC6A6	P31641	620 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	GSS	P48637	474 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	GSK3A	P49840	483 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	DLX6	P56179	175 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	COL10A1	Q03692	680 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	DTX3	Q8N9I9	347 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF511	Q8NB15	262 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	OR52J3	Q8NH60	311 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	SDSL	Q96GA7	329 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	REEP6	Q96HR9	211 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	OR5M11	Q96RB7	305 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	IFT27	Q9BW83	186 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	OPA3	Q9H6K4	179 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	CENPM	Q9NSP4	180 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198		A0A1W2PQ09	198 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198		H0YAE9	185 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	CST4	P01036	141 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	SEMG1	P04279	462 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	TFAP2A	P05549	437 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	NCK1	P16333	377 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	POU1F1	P28069	291 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	ALDH3B2	P48448	385 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	GSK3B	P49841	420 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC7A2	P52569	658 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	LSAMP	Q13449	338 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	FGD3	Q5JSP0	725 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	SPATA24	Q86W54	205 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	TMEM219	Q86XT9	240 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	CD177	Q8N6Q3	437 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	FANK1	Q8TC84	345 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	TFAP2C	Q92754	450 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	LYZL4	Q96KX0	146 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	RDH12	Q96NR8	316 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	AMELY	Q99218	206 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	COPS4	Q9BT78	406 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	OR51I2	Q9H344	312 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	NLK	Q9UBE8	527 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM4B-208	ENST00000534198	TENM2	Q9NT68	2774 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198		A0A1W2PRX2	142 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	DHRS12	A0PJE2	317 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	ODF3B	A8MYP8	253 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	TBX1	O43435	398 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	CCL3L1	P16619	93 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	MYF6	P23409	242 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	FAS	P25445	335 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	GABRA2	P47869	451 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	CX3CR1	P49238	355 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	ENTPD1	P49961	510 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	DYNLT3	P51808	116 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC25A1	P53007	311 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	SPIB	Q01892	262 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	ATP6AP1	Q15904	470 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM4B-208	ENST00000534198	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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