RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 ATP6V1B1P15313 513 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 LAP3P28838 519 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CALCRP30988 508 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SLC6A6P31641 620 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MTPNP58546 118 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ACTR3P61158 418 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1CBP62140 327 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ACTG1P63261 375 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 COX10Q12887 443 aa3.51□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa3.51□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 SMARCD3Q6STE5 483 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 DRAM2Q6UX65 266 aa3.51□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 Q71RC1 249 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 CLDN22Q8N7P3 220 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C3orf56Q8N813 242 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SMYD1Q8NB12 490 aa3.51□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C10orf82Q8WW14 230 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MAL2Q969L2 176 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 FAM162AQ96A26 154 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 HAVCR1Q96D42 359 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF75AQ96N20 296 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 OR8B2Q96RD0 313 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa3.51□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 GORASP2Q9H8Y8 452 aa3.51□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MED29Q9NX70 200 aa3.51□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 HAO2Q9NYQ3 351 aa3.51□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 TMEM89A2RUT3 159 aa3.5□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 SGCAQ16586 387 aa3.5□□□□□ -1.85
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HDAC2-216ENST00000523628 GPR157Q5UAW9 335 aa3.5□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CARD17Q5XLA6 110 aa3.5□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa3.5□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 PHC2Q8IXK0 858 aa3.5□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 MSRB3Q8IXL7 192 aa3.5□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 KIR3DL3Q8N743 410 aa3.5□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.5□□□□□ -1.85
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.5□□□□□ -1.85
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