RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	NICN1	Q9BSH3	213 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR54	Q9H977	334 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	UCK1	Q9HA47	277 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	GNB4	Q9HAV0	340 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RGS18	Q9NS28	235 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	NAGK	Q9UJ70	344 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		2.98	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CASZ1	Q86V15	1759 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ABCB11	O95342	1321 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0B4J2E0	115 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702		H7C417	338 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702		H7C423	109 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702		M0R1B8	84 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFSF13	O75888	250 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TTC4	O95801	387 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV3-23	P01764	117 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV3-13	P01766	116 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	FABP3	P05413	133 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	OR5AL1	P0C617	328 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ATF6	P18850	670 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DIO3	P55073	304 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	OR12D2	P58182	307 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CACNG7	P62955	275 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	HMGCS1	Q01581	520 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TRAM1	Q15629	374 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC14	Q49A88	953 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	IDNK	Q5T6J7	187 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MARC1	Q5VT66	337 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	EPGN	Q6UW88	154 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702		Q6ZVH6	145 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DCUN1D4	Q92564	292 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF145	Q96MT1	663 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SOST	Q9BQB4	213 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DSN1	Q9H410	356 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SNX24	Q9Y343	169 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0J9YXY3	114 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	ZW10	O43264	779 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	SERF1A	O75920	110 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	CHTF8	P0CG12	524 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	THRA	P10827	490 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	PSKH1	P11801	424 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB3B	P20337	219 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	MAG	P20916	626 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	MYL9	P24844	172 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	HLA-DMA	P28067	261 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	GGT2	P36268	569 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	MAGEA2	P43356	314 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC35A1	P78382	337 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	C2orf54	Q08AI8	447 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	SGCA	Q16586	387 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	RFX4	Q33E94	735 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		2.96	□□□□□ -1.94
FAM49B-222	ENST00000522702	THEM4	Q5T1C6	240 aa		2.96	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms