RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519885.5

TRAPPC2-208, Transcript of trafficking protein particle complex 2, human

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC2, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885		A6NJ64	397 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	GABRP	O00591	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	SYT7	O43581	403 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	SYNGR3	O43761	229 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	UPK3A	O75631	287 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CLPX	O76031	633 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CRYAA	P02489	173 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CD79A	P11912	226 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	VPREB1	P12018	145 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CBR1	P16152	277 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	RAB3B	P20337	219 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	GADD45A	P24522	165 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	STOM	P27105	288 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CHAT	P28329	748 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	MC5R	P33032	325 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	NR4A2	P43354	598 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	MAP2K4	P45985	399 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR12D2	P58182	307 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	GPR176	Q14439	515 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CTF1	Q16619	201 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	HSD17B8	Q92506	261 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	GHSR	Q92847	366 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TMEM106A	Q96A25	262 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	S100A13	Q99584	98 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TBX5	Q99593	518 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CDH20	Q9HBT6	801 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	FAM206A	Q9NX38	181 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	AIP	O00170	330 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	RHOD	O00212	210 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	RER1	O15258	196 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	SULT1B1	O43704	296 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	RAMP1	O60894	148 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	GPX5	O75715	221 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TGM6	O95932	706 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CYB5A	P00167	134 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	OPN1LW	P04000	364 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CALCB	P10092	127 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ZNF32	P17041	273 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	RAB3A	P20336	220 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	PRKACB	P22694	351 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CRYGS	P22914	178 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	TGFBR2	P37173	567 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CD79B	P40259	229 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	CRYBB2	P43320	205 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	AP3S2	P59780	193 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	DGCR2	P98153	550 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRAPPC2-208	ENST00000519885	PITPNA	Q00169	270 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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