RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR22Q99680 433 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q9BRP9 147 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM43Q9BTV4 400 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THTPAQ9BU02 230 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EMC6Q9BV81 110 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SFXN3Q9BWM7 321 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB33BQ9H082 229 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCB9Q9NP78 766 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRSS16Q9NQE7 514 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC39A1Q9NY26 324 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MOSPD1Q9UJG1 213 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VPREB3Q9UKI3 123 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa-0.66□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCC9O60706 1549 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GMNCA6NCL1 334 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARRDC5A6NEK1 342 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 F8VP50 259 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 K7EPK0 472 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LECT2O14960 151 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB29O14966 203 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRPSAP2O60256 369 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNNO75324 88 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLRA2P23416 452 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CXCR1P25024 350 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR1E1P30953 314 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC18A1P54219 525 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS15P62841 145 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NIPAL1Q6NVV3 410 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TICAM2Q86XR7 235 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF619Q8N2I2 560 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00337Q8N6G1 96 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SFXN5Q8TD22 340 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMBIM1Q969X1 311 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC126Q96EE4 140 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF170Q96K19 258 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q96M85 177 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TEAD3Q99594 435 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HEBP1Q9NRV9 189 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HRASLS2Q9NWW9 162 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAS2R9Q9NYW1 312 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAGKQ9UJ70 344 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KNSTRNQ9Y448 316 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCOR2Q9Y618 2525 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP8B3O60423 1300 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.67□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LAMA4Q16363 1823 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 K7ERS5 55 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NME4O00746 187 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC16A7O60669 478 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR12D1P0DN82 309 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB4AP20338 218 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB7AP51149 207 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FABP6P51161 128 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 XKP51811 444 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITIH4Q14624 930 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM229BQ4G0N7 80 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C6orf226Q5I0X4 101 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPM1LQ5SGD2 360 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 REEP3Q6NUK4 255 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q6ZTI0 123 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C2orf91Q6ZV80 131 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRINAQ7Z429 371 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM19A2Q8N3H0 131 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q8N6K4 173 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIFAP3Q92845 792 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAL2Q969L2 176 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNF8Q96H20 258 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q96MT0 163 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRPM6Q9BX84 2022 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSSK6Q9BXA6 273 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2D2Q9H210 308 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1orf21Q9H246 121 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VCX2Q9H322 139 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FANCEQ9HB96 536 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VCX3AQ9NNX9 186 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BABAM2Q9NXR7 383 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACTR3BQ9P1U1 418 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPIL1Q9Y3C6 166 aa-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COL18A1P39060 1754 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HPRT1P00492 218 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANXA5P08758 320 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DBTP11182 482 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CPMP14384 443 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BCKDHBP21953 392 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAGEA1P43355 309 aa-0.69□□□□□ -2.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INCA1Q0VD86 236 aa-0.69□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms