RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 CLPXO76031 633 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 KRT6AP02538 564 aa3.53□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 CT62P0C5K7 136 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 NCK1P16333 377 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 NPR2P20594 1047 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 COX5AP20674 150 aa3.53□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 BFARQ9NZS9 450 aa3.53□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 PLLPQ9Y342 182 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 AUP1Q9Y679 476 aa3.53□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 UPK3AO75631 287 aa3.52□□□□□ -1.85
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PDE4D-217ENST00000509355 OVOL2Q9BRP0 275 aa3.52□□□□□ -1.85
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 RHOJQ9H4E5 214 aa3.52□□□□□ -1.85
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PDE4D-217ENST00000509355 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-217ENST00000509355 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
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