RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, humanhuman

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1-218ENST00000495588 DPPA2Q7Z7J5 298 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 CATSPERDQ86XM0 798 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 PHC2Q8IXK0 858 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 CCDC36Q8IYA8 594 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 PRSS35Q8N3Z0 413 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF283Q8N7M2 679 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 OR8B12Q8NGG6 310 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 OR13F1Q8NGS4 319 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 LINC01560Q8TB33 94 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 UFD1Q92890 307 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF799Q96GE5 643 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 POM121L2Q96KW2 1035 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 PGLYRP3Q96LB9 341 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 C4orf45Q96LM5 186 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 PBOV1Q9GZY1 135 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 OR10A4Q9H209 315 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 NIPAL2Q9H841 368 aa4.71□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 KCNJ16Q9NPI9 418 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 NPAP1Q9NZP6 1156 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF319Q9P2F9 582 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF580Q9UK33 172 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC22A13Q9Y226 551 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa4.71□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 DSPP15924 2871 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa4.7□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 C5orf49A4QMS7 147 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 DPPA5A6NC42 116 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 OR4C45A6NMZ5 311 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 H3BSH0 61 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 M0R1B8 84 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 RHODO00212 210 aa4.7□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 IGLV1-44P01699 117 aa4.7□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 COX5BP10606 129 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 CD36P16671 472 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 AGAP20933 346 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 CALCRP30988 508 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 DCTDP32321 178 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 APLNRP35414 380 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 WNT5AP41221 380 aa4.7□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 GDI2P50395 445 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF83P51522 516 aa4.7□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 ECH1Q13011 328 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 TPBGQ13641 420 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 SNAI3Q3KNW1 292 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 BCL2L15Q5TBC7 163 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.7□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 XKRXQ6PP77 449 aa4.7□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 P2RY8Q86VZ1 359 aa4.7□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 ELMOD2Q8IZ81 293 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF101Q8IZC7 436 aa4.7□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 DNAAF1Q8NEP3 725 aa4.7□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 OR10AC1Q8NH08 325 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 RPS4Y2Q8TD47 263 aa4.7□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 GHSRQ92847 366 aa4.7□□□□□ -1.66
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GAPVD1-218ENST00000495588 MUCL1Q96DR8 90 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 SMIM19Q96E16 107 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 YIPF6Q96EC8 236 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 PERPQ96FX8 193 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 MED18Q9BUE0 208 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 OR51B6Q9H340 312 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 NDUFB11Q9NX14 153 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GAPVD1-218ENST00000495588 ATPIF1Q9UII2 106 aa4.7□□□□□ -1.66
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