RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 KIAA1456Q9P272 454 aa11.9□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 FAM96BQ9Y3D0 163 aa11.9□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 C21orf140B9A014 251 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 NTN1O95631 604 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PSMB3P49720 205 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 GNB1P62873 340 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 MICBQ29980 383 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 APH1BQ8WW43 257 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1B0GUH1 482 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 AQP7P3A6NL99 342 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CDC14BO60729 498 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SCARB1Q8WTV0 552 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 MARC2Q969Z3 335 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TRAPPC4Q9Y296 219 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.519e-9■■□□□ 14
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PQD3 144 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 EPOPA6NHQ4 379 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ADH4P08319 380 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 HLA-DOBP13765 273 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 RPL12P30050 165 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ADGRG3Q86Y34 549 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 UTRNP46939 3433 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 H3BP45 60 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SSSCA1O60232 199 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CLDN20P56880 219 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM108Q6UXF1 575 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 GLCCI1Q86VQ1 547 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 FBXW5Q969U6 566 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 GZMKP49863 264 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 Q8IYB0 196 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CMBLQ96DG6 245 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 GDF15Q99988 308 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 UQCC2Q9BRT2 126 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 FZR1Q9UM11 496 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SCN2AQ99250 2005 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 MED12Q93074 2177 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PKDREJQ9NTG1 2253 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 NGFP01138 241 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PDGFAP04085 211 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 IAPPP10997 89 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 LCN15Q6UWW0 184 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 C17orf107Q6ZR85 190 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 MRGPREQ86SM8 312 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 PTP4A1Q93096 173 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 LIPT2A6NK58 231 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF724A8MTY0 619 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CLN5O75503 358 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 KRASP01116 189 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 AVPR2P30518 371 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 MAGEA5P43359 124 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ERHP84090 104 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SCGB2A2Q13296 93 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ADIRFQ15847 76 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SP6Q3SY56 376 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CDONQ4KMG0 1287 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 DCAF10Q5QP82 559 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 LYG2Q86SG7 212 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 OR52B4Q8NGK2 314 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 E5RGE8 158 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 AQP7O14520 342 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 FABP1P07148 127 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SDHBP21912 280 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 GALP22466 123 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 C3AR1Q16581 482 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 ISXQ2M1V0 245 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 FAM58AQ8N1B3 248 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 OR52N4Q8NGI2 321 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CHST6Q9GZX3 395 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 DTX4Q9Y2E6 619 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 NSG2Q9Y328 171 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFB3O43676 98 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 OR5G3P0C626 314 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TOR2AQ5JU69 321 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 LHX4Q969G2 390 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms