RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 KAAG1Q9UBP8 84 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 MYRFQ9Y2G1 1151 aa16.05■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD61A6NGH8 418 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ENSAO43768 121 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 RHBDL1O75783 438 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 CLIC3O95833 236 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 KIR3DL2P43630 455 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 HAAOP46952 286 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 FDX2Q6P4F2 183 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 EGFL6Q8IUX8 553 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 RDH10Q8IZV5 341 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 OR5T2Q8NGG2 359 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 OR52I1Q8NGK6 324 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 TMIGD2Q96BF3 282 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 C10orf35Q96D05 121 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 SEH1LQ96EE3 360 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 MDFIQ99750 246 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR13Q9H1Z4 485 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ERVK13-1Q9NX77 482 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 FRRS1LQ9P0K9 344 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 IRGMA1A4Y4 181 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 NKX6-3A6NJ46 265 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 DVL1O14640 695 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 NDUFB3O43676 98 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 WBP4O75554 376 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 GATBO75879 557 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHA1P01876 353 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 LIPFP07098 398 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 FPR2P25090 351 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 CCR9P51686 369 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 PAX2Q02962 417 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 IL18R1Q13478 541 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 SYS1Q8N2H4 156 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 CNIH3Q8TBE1 160 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ST8SIA4Q92187 359 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 AQP3Q92482 292 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 PELI1Q96FA3 418 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 NLKQ9UBE8 527 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ECDO95905 644 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 GABRA2P47869 451 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC10Q5BKY1 277 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 BPIFB2Q8N4F0 458 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 MED30Q96HR3 178 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 DNTTIP1Q9H147 329 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 RASL12Q9NYN1 266 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 NUP50Q9UKX7 468 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 HHLA2Q9UM44 414 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0A6YYJ9 748 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 PQLC2LA1A4F0 135 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 C22orf46C9J442 243 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 J3QT63 122 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ISG15P05161 165 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF20P17024 532 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CAPGP40121 348 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 FUT6P51993 359 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 C11orf91Q3C1V1 193 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 STUMQ69YW2 141 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 BTN2A1Q7KYR7 527 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 NPRL2Q8WTW4 380 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 PP6455Q8WZ26 134 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 SMURF1Q9HCE7 757 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 OR2AT4A6NND4 320 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 H0YAE9 185 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 PPIAL4GP0DN37 164 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 DCKP27707 260 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 TGM4P49221 684 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC34A1Q06495 639 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 IKZF1Q13422 519 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 MED21Q13503 144 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 UBE2V2Q15819 145 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM216BQ8N7L0 139 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 POC1AQ8NBT0 407 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms