RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 LIMS3P0CW19 117 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 LIMS4P0CW20 117 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 NPY4RP50391 375 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 IL18R1Q13478 541 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 MICBQ29980 383 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 SYS1Q8N2H4 156 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 SETD9Q8NE22 299 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 JAM3Q9BX67 310 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 CHST5Q9GZS9 411 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 KAAG1Q9UBP8 84 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 DUX4Q9UBX2 424 aa11.71□□□□□ -0.53
SRRT-210ENST00000477529 PQLC2LA1A4F0 135 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 OR4C45A6NMZ5 311 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 C22orf46C9J442 243 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 J3QLW9 94 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 TMPRSS2O15393 492 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 NDUFA2O43678 99 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 ISG15P05161 165 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 HTR1AP08908 422 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 ZNF19P17023 458 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 AMY2BP19961 511 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 CAPGP40121 348 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 CCR9P51686 369 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 GMFBP60983 142 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 STUMQ69YW2 141 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 RDH10Q8IZV5 341 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 FGFRL1Q8N441 504 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 OR10AC1Q8NH08 325 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 AQP3Q92482 292 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 TECTBQ96PL2 329 aa11.7□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 H0YAE9 185 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 J3QT63 122 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 SYNGR1O43759 233 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 PAX8Q06710 450 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 KLHL22Q53GT1 634 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 TMEM244Q5VVB8 128 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 LAIR2Q6ISS4 152 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 CALHM1Q8IU99 346 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 TEX29Q8N6K0 151 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 FAM216BQ8N7L0 139 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 NRG4Q8WWG1 115 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 MDFIQ99750 246 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 MRI1Q9BV20 369 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 ERVK-18Q9QC07 812 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 METRNQ9UJH8 293 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa11.69□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 E9PI62 339 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 DVL1O14640 695 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 TFF1P04155 84 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 SELLP14151 372 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 EPHA1P21709 976 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 GLRA1P23415 457 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 HAAOP46952 286 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 ETV1P50549 477 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 SLC34A1Q06495 639 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 UBE2V2Q15819 145 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 ARMCX4Q5H9R4 360 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 EGFL6Q8IUX8 553 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 OR5T2Q8NGG2 359 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 OR51A4Q8NGJ6 313 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 ANGPTL6Q8NI99 470 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 NANPQ8TBE9 248 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 NPRL2Q8WTW4 380 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 FBLIM1Q8WUP2 373 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 C10orf35Q96D05 121 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 CCL13Q99616 98 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 RASSF4Q9H2L5 321 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 VCXQ9H320 206 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 DNAJB11Q9UBS4 358 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 HHLA2Q9UM44 414 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 AUP1Q9Y679 476 aa11.68□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 ENSAO43768 121 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 GATBO75879 557 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 PGA5P0DJD9 388 aa11.67□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 MPZP25189 248 aa11.67□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 DCKP27707 260 aa11.67□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SRRT-210ENST00000477529 XAF1Q6GPH4 301 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms