RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 PRSS35Q8N3Z0 413 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 APH1BQ8WW43 257 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 C10orf35Q96D05 121 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 C4orf36Q96KX1 117 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC7A11Q9UPY5 501 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP1-205ENST00000466097 IRGMA1A4Y4 181 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 A6NIN4 97 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 NKX6-3A6NJ46 265 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 H3BSH0 61 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 GATBO75879 557 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 SERPINA3P01011 423 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHA1P01876 353 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 PPIAL4GP0DN37 164 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 GLRA1P23415 457 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 KIR3DL2P43630 455 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 CCR9P51686 369 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 PAX8Q06710 450 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 IL18R1Q13478 541 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf91Q3C1V1 193 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 LHFPL3Q86UP9 236 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 AQP3Q92482 292 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 PELI1Q96FA3 418 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 DNTTIP1Q9H147 329 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 ERVK13-1Q9NX77 482 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 MYRFQ9Y2G1 1151 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A0A6YYJ9 748 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 J3QT63 122 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 DVL1O14640 695 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 WBP4O75554 376 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 RHBDL1O75783 438 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 CLIC3O95833 236 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 ECDO95905 644 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 FSHBP01225 129 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 ISG15P05161 165 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 LIPFP07098 398 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 RPSAP08865 295 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 FPR2P25090 351 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 HAAOP46952 286 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 STUMQ69YW2 141 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 BPIFB2Q8N4F0 458 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 OR52I1Q8NGK6 324 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 PP6455Q8WZ26 134 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 TMIGD2Q96BF3 282 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 CCL13Q99616 98 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 CHST5Q9GZS9 411 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 WDR13Q9H1Z4 485 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 SMURF1Q9HCE7 757 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 SNTG1Q9NSN8 517 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 FRRS1LQ9P0K9 344 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 NLKQ9UBE8 527 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 CUBNO60494 3623 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 PQLC2LA1A4F0 135 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 C22orf46C9J442 243 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR37O15354 613 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 NDUFB3O43676 98 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF20P17024 532 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 DCKP27707 260 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 SMIM21Q3B7S5 101 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC10Q5BKY1 277 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 RDH10Q8IZV5 341 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF676Q8N7Q3 588 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 OR5T2Q8NGG2 359 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 CNIH3Q8TBE1 160 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 ST8SIA4Q92187 359 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 SEH1LQ96EE3 360 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 MED30Q96HR3 178 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 JMJD8Q96S16 334 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 SUCNR1Q9BXA5 334 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 RASSF4Q9H2L5 321 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 RASL12Q9NYN1 266 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 NUP50Q9UKX7 468 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 HHLA2Q9UM44 414 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 ERICH4A6NGS2 130 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 OR2AT4A6NND4 320 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 H0YAE9 185 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC159P0C7I6 412 aa12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms