RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 TGFBR2P37173 567 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 PMELP40967 661 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CD200P41217 278 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 GPM6AP51674 278 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 FABP5Q01469 135 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 MPPED2Q15777 294 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CARTPTQ16568 116 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM209AQ5JX71 171 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF144BQ7Z419 303 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR86Q86TI4 376 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 SPERTQ8NA61 448 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 YIPF5Q969M3 257 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ITFG2Q969R8 447 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM106AQ96A25 262 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 C10orf35Q96D05 121 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 MBD6Q96DN6 1003 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 DERL3Q96Q80 235 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CHST5Q9GZS9 411 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 NOX4Q9NPH5 578 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 IL19Q9UHD0 177 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CACNG2Q9Y698 323 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 NOTCH2Q04721 2471 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 LRBAP50851 2863 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 GABRPO00591 440 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CD2P06729 351 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CD36P16671 472 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 TNFRSF1AP19438 455 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CRYBB2P43320 205 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 MZT1Q08AG7 82 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 TESK1Q15569 626 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAM1Q15629 374 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 UTS2BQ765I0 119 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF525Q8N782 197 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 PP6455Q8WZ26 134 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CCL17Q92583 94 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 RDH5Q92781 318 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 Q96M66 194 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 SPACA5Q96QH8 159 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 GCM1Q9NP62 436 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ABCB9Q9NP78 766 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 A6NLC8 198 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CDIPTO14735 213 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 SULT1B1O43704 296 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 GPX5O75715 221 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 SC5DO75845 299 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 PLATP00750 562 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 MAS1P04201 325 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB3AP20336 220 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 PRKACBP22694 351 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 GADD45AP24522 165 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms