RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HTR1AP08908 422 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF19P17023 458 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EGR1P18146 543 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ETV1P50549 477 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERVK11-1P61568 191 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CSNK2BP67870 215 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PAX8Q06710 450 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBE2V2Q15819 145 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TEX29Q8N6K0 151 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DEFB108BQ8NET1 73 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR4M2Q8NGB6 313 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRC29Q8WV35 223 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PP6455Q8WZ26 134 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BEX2Q9BXY8 128 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHST5Q9GZS9 411 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SHARPINQ9H0F6 387 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MMP26Q9NRE1 261 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RASL12Q9NYN1 266 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBAP1Q9NZ09 502 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERVK-18Q9QC07 812 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OPN4Q9UHM6 478 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 INSIG2Q9Y5U4 225 aa9.35□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EFCAB10A6NFE3 127 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKRD61A6NGH8 418 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERICH4A6NGS2 130 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 E9PI62 339 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPR37O15354 613 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZFPL1O95159 310 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF205O95201 554 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPM6AP51674 278 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MICBQ29980 383 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ESCO2Q56NI9 601 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEP78Q5JTW2 689 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STUMQ69YW2 141 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF529Q6P280 563 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF788Q6ZQV5 615 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF573Q86YE8 665 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RDH10Q8IZV5 341 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR52N1Q8NH53 320 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF671Q8TAW3 534 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM80Q96HE8 168 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PKIBQ9C010 78 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HES4Q9HCC6 221 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CTSZQ9UBR2 303 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HHLA2Q9UM44 414 aa9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A6NLC8 198 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM212A6NML5 194 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RHBDL1O75783 438 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CD1AP06126 327 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC159P0C7I6 412 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PGA5P0DJD9 388 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPS2P15880 293 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HNF1AP20823 631 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CD80P33681 288 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PITPNBP48739 271 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FUT6P51993 359 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AQP4P55087 323 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ST3GAL4Q11206 333 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MOB3CQ70IA8 216 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 POC1AQ8NBT0 407 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR8B3Q8NGG8 313 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR8B2Q96RD0 313 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NRIP2Q9BQI9 281 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BABAM2Q9NXR7 383 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF222Q9UK12 451 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.33□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 J3QT63 122 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GATBO75879 557 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SERPINA3P01011 423 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LIPFP07098 398 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYF6P23409 242 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LCN2P80188 198 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IL24Q13007 206 aa9.32□□□□□ -0.92
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDK5R1Q15078 307 aa9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms