RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.87□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 GPR132Q9UNW8 380 aa14.87□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.87□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 A0A087WV62 115 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 UBE2V2Q15819 145 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 OR5R1Q8NH85 324 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 INTS14Q96SY0 518 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 AMELYQ99218 206 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 STRADBQ9C0K7 418 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 RAB22AQ9UL26 194 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 FAM186AA6NE01 2351 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 CT62P0C5K7 136 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 DANCRP0C864 163 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 SLC35E2P0CK97 266 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 CHATP28329 748 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF616Q08AN1 781 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 CHST4Q8NCG5 386 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 FBXL17Q9UF56 701 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.86□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 PTPRBP23467 1997 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 CTXN1P60606 82 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 SLC17A1Q14916 467 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 OR8G1Q15617 311 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 FAM219AQ8IW50 185 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 CMBLQ96DG6 245 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 OR8B4Q96RC9 309 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 LUZP4Q9P127 313 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 MEMO1Q9Y316 297 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 K7EPK0 472 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 OR13C7P0DN81 318 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 NHLH2Q02577 135 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 TSLPQ969D9 159 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 FAM46BQ96A09 425 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 PRR13Q9NZ81 148 aa14.85□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 A8MWP6 167 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF264O43296 627 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 SYT7O43581 403 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 SFTPBP07988 381 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 FCGR2CP31995 323 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 MEP1BQ16820 701 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 OR4K15Q8NH41 348 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 OTOSQ8NHW6 89 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 M1APQ8TC57 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 SDK2Q58EX2 2172 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 PNPP00491 289 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 FABP4P15090 132 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM33P57088 247 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 ELOBQ15370 118 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 CBY1Q9Y3M2 126 aa14.84□□□□□ -0.03
CNGA3-205ENST00000436404 H7C1C5 153 aa14.83□□□□□ -0.04
CNGA3-205ENST00000436404 TXNDC12O95881 172 aa14.83□□□□□ -0.04
CNGA3-205ENST00000436404 SEC11BP0C7V7 166 aa14.83□□□□□ -0.04
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF708P17019 499 aa14.83□□□□□ -0.04
CNGA3-205ENST00000436404 S1PR1P21453 382 aa14.83□□□□□ -0.04
CNGA3-205ENST00000436404 CAMLGP49069 296 aa14.83□□□□□ -0.04
CNGA3-205ENST00000436404 LCN6P62502 163 aa14.83□□□□□ -0.04
CNGA3-205ENST00000436404 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CNGA3-205ENST00000436404 SPOCK1Q08629 439 aa14.83□□□□□ -0.04
CNGA3-205ENST00000436404 ALG10Q5BKT4 473 aa14.83□□□□□ -0.04
CNGA3-205ENST00000436404 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms