RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 IGKV1D-12P01611 117 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 HPXP02790 462 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF735P0CB33 412 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 PER3P56645 1201 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 PRDX4Q13162 271 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 RSU1Q15404 277 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 TBR1Q16650 682 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 ZFP69Q49AA0 526 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 OR52W1Q6IF63 320 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC36Q8IYA8 594 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 NAXEQ8NCW5 288 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 IFT46Q9NQC8 304 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 K7ENP7 123 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 PRAF2O60831 178 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 TOXO94900 526 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 AMY2AP04746 511 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D28Q2M2D7 210 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 OR11H7Q8NGC8 314 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 STARD4Q96DR4 205 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 Q96M66 194 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1B0GUH1 482 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 CGAP01215 116 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 CPT2P23786 658 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 MECP2P51608 486 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 PDZK1IP1Q13113 114 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 CD276Q5ZPR3 534 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 TCTE3Q8IZS6 198 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF610Q8N9Z0 462 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 EXTL1Q92935 676 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 SEC22CQ9BRL7 303 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 PECRQ9BY49 303 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 OPA3Q9H6K4 179 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 PROCRQ9UNN8 238 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM215AQ9Y5M1 114 aa18.59■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 ACACAQ13085 2346 aa18.58■□□□□ 0.57
SH3BP5-204ENST00000412806 CST4P01036 141 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CSTBP04080 98 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNJ8Q15842 424 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CD163Q86VB7 1156 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CALHM1Q8IU99 346 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 BPIFB2Q8N4F0 458 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 RPRMLQ8N4K4 120 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP18.58■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 ING3Q9NXR8 418 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CD300LBA8K4G0 201 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 GABRR1P24046 479 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.569e-6■■□□□ 14.4
SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf185Q5T7R7 199 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM180AQ6UWF9 173 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR31Q8NA23 367 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 PXT1Q8NFP0 134 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 HPSE2Q8WWQ2 592 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC6A7Q99884 636 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 ANAPC10Q9UM13 185 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 ESPL1Q14674 2120 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 PQLC2LA1A4F0 135 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR1O75083 606 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CSN2P05814 226 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 METTL11BQ5VVY1 283 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 BHLHE23Q8NDY6 225 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 OR5L1Q8NGL2 311 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 BOD1Q96IK1 185 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 AGFG2O95081 481 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 VSIG10L2P0DP72 767 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 ARFRP1Q13795 201 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 NKPD1Q17RQ9 610 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 KRTCAP3Q53RY4 240 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 SPATA46Q5T0L3 261 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 IDO2Q6ZQW0 420 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 ST8SIA4Q92187 359 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 SNAPC3Q92966 411 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CDH20Q9HBT6 801 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 SMPD2O60906 423 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 LILRA1O75019 489 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 IL5P05113 134 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 SFTPBP07988 381 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CXCL3P19876 107 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 MAB21L1Q13394 359 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 MEF2DQ14814 521 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CEACAM21Q3KPI0 293 aa18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms