RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 ARRDC5A6NEK1 342 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 SNTNA6NMZ2 147 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 RGS5O15539 181 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 DIRAS3O95661 229 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 HPRT1P00492 218 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 C1QCP02747 245 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR4P46093 362 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 GRB2P62993 217 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 INAQ16352 499 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM236Q5W0B7 351 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 C12orf54Q6X4T0 127 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR2M7Q8NG81 312 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATP5SQ99766 215 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 C1orf21Q9H246 121 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 LAMA4Q16363 1823 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 HERC1Q15751 4861 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 TSPAN11A1L157 253 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 A6NED7 52 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 SMC2O95347 1197 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 SERPINE2P07093 398 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 PAX6P26367 422 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 HTR2CP28335 458 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 ADIGQ0VDE8 80 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 PSMD5Q16401 504 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 HADHQ16836 314 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 C10orf91Q5T1B1 145 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 CLEC18BQ6UXF7 455 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 RGS9BPQ6ZS82 235 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 CBLN2Q8IUK8 224 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 LFNGQ8NES3 379 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 SDR9C7Q8NEX9 313 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC110Q8TBZ0 833 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 RDH12Q96NR8 316 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR22Q99680 433 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q9BRP9 147 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 TPPP3Q9BW30 176 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 KNSTRNQ9Y448 316 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 RTTNQ86VV8 2226 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.85□□□□□ -2.54
RNU2-38P-201ENST00000410856 A0A075B6Q4 140 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRT87PA6NCN2 255 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 F5H5P2 479 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 ISLRO14498 428 aa-0.85□□□□□ -2.55
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RNU2-38P-201ENST00000410856 KRT13P13646 458 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 CPMP14384 443 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
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RNU2-38P-201ENST00000410856 PPICP45877 212 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 XKP51811 444 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC18A1P54219 525 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 MGAT3Q09327 533 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 ELP2Q6IA86 826 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 CERS6Q6ZMG9 384 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR10P1Q8NGE3 313 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 ORAOV1Q8WV07 137 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 NDUFB11Q9NX14 153 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa-0.85□□□□□ -2.55
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RNU2-38P-201ENST00000410856 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 IQCF3P0C7M6 154 aa-0.86□□□□□ -2.55
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RNU2-38P-201ENST00000410856 PGA5P0DJD9 388 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 MYCNOSP40205 109 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 HTR2BP41595 481 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 RPS15P62841 145 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 BST1Q10588 318 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 ITIH4Q14624 930 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q6ZSR3 168 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC22A9Q8IVM8 553 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR6K6Q8NGW6 343 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 NUBPLQ8TB37 319 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 UBE2E2Q96LR5 201 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 COQ10BQ9H8M1 238 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 MED9Q9NWA0 146 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 JCADQ9P266 1359 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRPM6Q9BX84 2022 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa-0.87□□□□□ -2.55
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