RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 TOXO94900 526 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 SCGB1D2O95969 90 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV3-15P01624 115 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CD74P04233 296 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TCRBP04435 133 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 LPLP06858 475 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 HCKP08631 526 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CSF1P09603 554 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CD79AP11912 226 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 PTHLHP12272 177 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CBR1P16152 277 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 MPZP25189 248 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 PRSS3P35030 304 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 WNT5AP41221 380 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 UCNP55089 124 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM50BP56557 158 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 P2RY6Q15077 328 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 GSG1Q2KHT4 349 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 GFOD2Q3B7J2 385 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 HIKESHIQ53FT3 197 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM255AQ5JRV8 349 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 C9orf135Q5VTT2 229 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 AWAT2Q6E213 333 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 OR10K2Q6IF99 312 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 BTN2A1Q7KYR7 527 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 MDP1Q86V88 176 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 GLCCI1Q86VQ1 547 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 WDR31Q8NA23 367 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM104Q8NE00 496 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 PXT1Q8NFP0 134 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 OR5M9Q8NGP3 310 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 OR10R2Q8NGX6 335 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 FAM57AQ8TBR7 257 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 WBP1Q96G27 269 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 SLX1AQ9BQ83 275 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CACNG6Q9BXT2 260 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ACTR6Q9GZN1 396 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 DPAGT1Q9H3H5 408 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 NEK6Q9HC98 313 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ETAA1Q9NY74 926 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 IL36GQ9NZH8 169 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa5.18□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 RTTNQ86VV8 2226 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 C5orf49A4QMS7 147 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 MFNGO00587 321 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 RRP8O43159 456 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ZNHIT1O43257 154 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 AKR7A2O43488 359 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 NRASP01111 189 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 NGFP01138 241 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 IGLV1-44P01699 117 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 MT-ND4P03905 459 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TUBG1P23258 451 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 GIFP27352 417 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 APLNRP35414 380 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 RBP2P50120 134 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 FUT6P51993 359 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ACTBP60709 375 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ACTG1P63261 375 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CD300CQ08708 224 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 FOXF2Q12947 444 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 TATDN3Q17R31 274 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 C1orf185Q5T7R7 199 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 MTFR2Q6P444 385 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 VWA1Q6PCB0 445 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 GCNT2Q8N0V5 402 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 SLC30A7Q8NEW0 376 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 STEAP2Q8NFT2 490 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 ST8SIA4Q92187 359 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 PHF21AQ96BD5 680 aa5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
C6orf48-208ENST00000395788 MED30Q96HR3 178 aa5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms