RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 ELMOD3Q96FG2 381 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CMTM3Q96MX0 182 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM204Q9BSN7 226 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 A6NNC1 897 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 F5H5P2 479 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TRAPPC2LH3BP13 241 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CTDSP2O14595 271 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 MLNRO43193 412 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SIAH2O43255 324 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 HTR3BO95264 441 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CD37P11049 281 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 BMP4P12644 408 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 COX6B1P14854 86 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SERPINA2P20848 420 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ALDH3B1P43353 468 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 MMP15P51511 669 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 PDZK1IP1Q13113 114 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 MSMPQ1L6U9 139 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM255AQ5JRV8 349 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 FAM166AQ6J272 317 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZR03 302 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 OR2W3Q7Z3T1 314 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 LAX1Q8IWV1 398 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 MUC15Q8N387 334 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 PXT1Q8NFP0 134 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 OR51F2Q8NH61 342 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 KCNG3Q8TAE7 436 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TBC1D15Q8TC07 691 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 RAB40AQ8WXH6 277 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 DIRAS2Q96HU8 199 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 PKIBQ9C010 78 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 MS4A5Q9H3V2 200 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 HMG20AQ9NP66 347 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 DECR2Q9NUI1 292 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 OR5V1Q9UGF6 321 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 RAB22AQ9UL26 194 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 A1L4Q6 167 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 METTL21EPA6NDL7 271 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 J3QT63 122 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 HS3ST1O14792 307 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ANGPTL7O43827 346 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 APOA1P02647 267 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 RNF224P0DH78 156 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 NAT2P11245 290 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 RAB6AP20340 208 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 LOXP28300 417 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ZP1P60852 638 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 LSAMPQ13449 338 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 EFNB3Q15768 340 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SLC22A6Q4U2R8 563 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 AGAP6Q5VW22 663 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A26Q70HW3 274 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SAXO1Q8IYX7 474 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 OR5H6Q8NGV6 325 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A28Q96A46 364 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 WDFY2Q96P53 400 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM59Q9BXS4 323 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 EGLN1Q9GZT9 426 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ATG5Q9H1Y0 275 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 UBTD1Q9HAC8 227 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 DIABLOQ9NR28 239 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 C17orf100A8MU93 164 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SCGNO76038 276 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 MPIG6BO95866 241 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 GTF2F2P13984 249 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TNFRSF1AP19438 455 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TNFSF8P32971 234 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CD200P41217 278 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 IL24Q13007 206 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF154Q13106 437 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF846Q147U1 533 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 FAM131AQ6UXB0 335 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 RNF144BQ7Z419 303 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 LYPD6Q86Y78 171 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CALHM1Q8IU99 346 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 Q8IYB0 196 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SCCPDHQ8NBX0 429 aa10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms