RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM38AQ9H6F2 299 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AUNIPQ9H7T9 357 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TUBA4BQ9H853 241 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C12orf10Q9HB07 376 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ACP6Q9NPH0 428 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FBXO8Q9NRD0 319 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HEBP1Q9NRV9 189 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 VAPAQ9P0L0 249 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC17A7Q9P2U7 560 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MTFP1Q9UDX5 166 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRO0628Q9UI54 55 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF391Q9UJN7 358 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CFAP45Q9UL16 551 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ST3GAL6Q9Y274 331 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 INSIG2Q9Y5U4 225 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NACAE9PAV3 2078 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PTPRKQ15262 1439 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A0J9YXV3 536 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM72A0PK05 275 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GRIFINA4D1Z8 144 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IZUMO1RA6ND01 250 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARGFXA6NJG6 315 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SUPT3HB4E1H0 165 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C15orf65H3BRN8 121 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LGALS9O00182 355 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GABRPO00591 440 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NME4O00746 187 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AQP9O43315 295 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DENRO43583 198 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ALOX12BO75342 701 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRAPPC6AO75865 159 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AQP8O94778 261 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 VAPBO95292 243 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CATP04040 527 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GYPCP04921 128 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CD5P06127 495 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR4A8P0C604 315 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCDC172P0C7W6 258 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TLX1NBP0CAT3 122 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IFI30P13284 250 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ANXA8P13928 327 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF43P17038 809 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GZMHP20718 246 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GSTM3P21266 225 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GALP22466 123 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GABRR2P28476 465 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR1E1P30953 314 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PYCR1P32322 319 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GGT2P36268 569 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GPR4P46093 362 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HSPA13P48723 471 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TGM4P49221 684 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TTPAP49638 278 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 XKP51811 444 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CRISP3P54108 245 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EMP2P54851 167 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GFERP55789 205 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CLDN18P56856 261 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RBX1P62877 108 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GRB2P62993 217 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC35B1P78383 322 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRR3P79522 188 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SEMG2Q02383 582 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RELAQ04206 551 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 REG3AQ06141 175 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C2orf80Q0P641 193 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BST1Q10588 318 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GK3PQ14409 553 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ITIH4Q14624 930 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR1Q1Q15612 314 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 VAMP3Q15836 100 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RAB11BQ15907 218 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GABRA6Q16445 453 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MAPK14Q16539 360 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ATP6V1FQ16864 119 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C5orf64Q2M2E5 130 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM52BQ4KMG9 183 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PYCR3Q53H96 274 aa0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms