RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355540.7

TRRAP-201, Transcript of transformation/transcription domain associated protein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRRAP, Length 12,590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAP-201ENST00000355540 PIGPP57054 158 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ZNF345Q14585 488 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 SGK494L7N484 410 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 GPANK1O95872 356 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ZNF17P17021 662 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 STPG2Q8N412 459 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ASB11Q8WXH4 323 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 LHX4Q969G2 390 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 SGK494Q96LW2 274 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 UPK2O00526 184 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 TGFBR1P36897 503 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 CLDN18P56856 261 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 TESK1Q15569 626 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 TCF24Q7RTU0 167 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 OXGR1Q96P68 337 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 TMEM250H0YL14 139 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ZP3P21754 424 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ZNF534Q76KX8 674 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 IGSF8Q969P0 613 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ZNF778Q96MU6 729 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 PTPRDP23468 1912 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 STC2O76061 302 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 HAGHQ16775 308 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.358e-8■■■■■ 29.3
TRRAP-201ENST00000355540 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 LRTM2Q8N967 370 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 RHCGQ9UBD6 479 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 WDR1O75083 606 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 CD8BP10966 210 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 NEUROG1Q92886 237 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 LRP5O75197 1615 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 A8MUA0 341 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 UBE2L6O14933 153 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 XRCC3O43542 346 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 CST4P01036 141 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 HLA-DQA1P01909 254 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 RBP4P02753 201 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 GLRA1P23415 457 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 CD27P26842 260 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 FCER1GP30273 86 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 MC5RP33032 325 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 CA13Q8N1Q1 262 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 SLC17A3O00476 420 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 T-ENOLP0DO92 83 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 PGGT1BP53609 377 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 HIST3H3Q16695 136 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 CXorf1O96002 111 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 PSMB2P49721 201 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 RELAQ04206 551 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 PIAS1O75925 651 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 CD22P20273 847 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 GDNFP39905 211 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ACY3Q96HD9 319 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 PRNDQ9UKY0 176 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 R4GMQ9 66 aa6.6□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 PRSS56P0CW18 603 aa6.59□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 H3BQ85 93 aa6.59□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 BET1O15155 118 aa6.59□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 GABRG2P18507 467 aa6.59□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 GZMHP20718 246 aa6.59□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 NUBP1P53384 320 aa6.59□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 GUCA2AQ02747 115 aa6.59□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 OPCMLQ14982 345 aa6.59□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ABHD4Q8TB40 342 aa6.59□□□□□ -1.35
TRRAP-201ENST00000355540 ABHD3Q8WU67 409 aa6.59□□□□□ -1.35
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