RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 IFI44Q8TCB0 444 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 RLN3Q8WXF3 142 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 WNT11O96014 354 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 IGHV3-9P01782 118 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 PEX11BO96011 259 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 PLA2G10O15496 165 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 FZD6O60353 706 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 ICAM2P13598 275 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 FAHP16930 419 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 GLRA1P23415 457 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 STUMQ69YW2 141 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 TMEM65Q6PI78 240 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 EDDM3BP56851 147 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 ST8SIA1Q92185 356 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 SIRT7Q9NRC8 400 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 MED29Q9NX70 200 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 FBXL17Q9UF56 701 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 A0A1B0GX78 115 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 HAAOP46952 286 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 SMIM12Q96EX1 92 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 OPN4Q9UHM6 478 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 HMGA2P52926 109 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 TBC1D28Q2M2D7 210 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 OR4A47Q6IF82 309 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 TET1Q8NFU7 2136 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 OR5K3A6NET4 321 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 COL19A1Q14993 1142 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 OR8G1Q15617 311 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 OR5AS1Q8N127 324 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 OR11L1Q8NGX0 322 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 IDSB3KWA1 339 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 M0R1X1 148 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 RAB32Q13637 225 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 TMEM104Q8NE00 496 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 CD1CP29017 333 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 ZNF79Q15937 498 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 WDR38Q5JTN6 314 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 FAM26DQ5JW98 314 aa9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 STPG2Q8N412 459 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 FGF22Q9HCT0 170 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 ADPRHP54922 357 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 TAS2R45P59539 299 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 KIAA0040Q15053 153 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 RDH5Q92781 318 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 SLC35E1Q96K37 410 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 NHLH1Q02575 133 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 NHLH2Q02577 135 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 A0A0B4J2E0 115 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 A0A1B0GX12 115 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 ZNF749O43361 778 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 ADGRG7Q96K78 797 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 SIAH2O43255 324 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 CA13Q8N1Q1 262 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 OR10C1Q96KK4 312 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 SH2D1BO14796 132 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 ZNF17P17021 662 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 BTG2P78543 158 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 HTRA3P83110 453 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 OR1D5P58170 312 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.15□□□□□ -0.94
TTL-201ENST00000233336 A0A087WUJ7 227 aa9.15□□□□□ -0.95
TTL-201ENST00000233336 PCNX1Q96RV3 2341 aa9.15□□□□□ -0.95
TTL-201ENST00000233336 ERVH48-1M5A8F1 160 aa9.15□□□□□ -0.95
TTL-201ENST00000233336 GABRA1P14867 456 aa9.15□□□□□ -0.95
TTL-201ENST00000233336 SULT1A1P50225 295 aa9.15□□□□□ -0.95
TTL-201ENST00000233336 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.15□□□□□ -0.95
TTL-201ENST00000233336 OSR2Q8N2R0 312 aa9.15□□□□□ -0.95
TTL-201ENST00000233336 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms