RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 C4orf46Q504U0 113 aa20.7■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 NAXEQ8NCW5 288 aa20.7■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 OR52B4Q8NGK2 314 aa20.7■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 OR4K15Q8NH41 348 aa20.7■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 WNT2BQ93097 391 aa20.7■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 PECRQ9BY49 303 aa20.7■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 POFUT1Q9H488 388 aa20.7■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 OPA3Q9H6K4 179 aa20.7■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
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RPUSD1-201ENST00000007264 SERPINE3A8MV23 424 aa20.69■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
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RPUSD1-201ENST00000007264 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa20.69■□□□□ 0.9
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RPUSD1-201ENST00000007264 Q96M66 194 aa20.69■□□□□ 0.9
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RPUSD1-201ENST00000007264 Q6ZT83 130 aa20.68■□□□□ 0.9
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RPUSD1-201ENST00000007264 OR5L1Q8NGL2 311 aa20.68■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
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RPUSD1-201ENST00000007264 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 OR14I1A6ND48 311 aa20.68■□□□□ 0.9
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RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF585AQ6P3V2 769 aa20.68■□□□□ 0.9
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RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC36Q8IYA8 594 aa20.68■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 C9orf106Q8NAJ2 232 aa20.68■□□□□ 0.9
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RPUSD1-201ENST00000007264 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 CA11O75493 328 aa20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 OR4E1P0C645 316 aa20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 SPINK2P20155 84 aa20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 HOXC12P31275 282 aa20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 PER3P56645 1201 aa20.65■□□□□ 0.9
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