RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635206.1

CCDC149-208, Transcript of coiled-coil domain containing 149, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC149, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC149-208	ENST00000635206	TOX	O94900	526 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	UBB	P0CG47	229 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	ALDH3B1	P43353	468 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206		K7ENP7	123 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	SERPINA5	P05154	406 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	TPO	P07202	933 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	TMEM225B	P0DP42	221 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	MGMT	P16455	207 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	S100A1	P23297	94 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	TMEM50B	P56557	158 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	GABRA6	Q16445	453 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	FAM209A	Q5JX71	171 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	OR2A2	Q6IF42	318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	OR56B4	Q8NH76	319 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	BSN	Q9UPA5	3926 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	PRKACB	P22694	351 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	PER3	P56645	1201 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	TGFBR3	Q03167	851 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	MALL	Q13021	153 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	STARD4	Q96DR4	205 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	BORCS8	Q96FH0	119 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	S100A13	Q99584	98 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	NEK6	Q9HC98	313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	GHRL	Q9UBU3	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206		M0QYG6	137 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	SSX5	O60225	188 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	DHFR	P00374	187 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	CHRM2	P08172	466 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	MELTF	P08582	738 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	AKAIN1	P0CW23	69 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	RBP2	P50120	134 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	ACTB	P60709	375 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	ACTG1	P63261	375 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	CD83	Q01151	205 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	C4orf46	Q504U0	113 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	CD163	Q86VB7	1156 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	BEST4	Q8NFU0	473 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	RAB3C	Q96E17	227 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	CST11	Q9H112	138 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	FAM25E	A8MYX2	175 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	AGFG2	O95081	481 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	COX5A	P20674	150 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	WBP1	Q96G27	269 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CCDC149-208	ENST00000635206	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55

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