RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAH3Q8TD57 4116 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 GLCEO94923 617 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 VSIG8P0DPA2 414 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLL1P15814 213 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PAICSP22234 425 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TIGD4Q8IY51 512 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PIGCQ92535 297 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CD300AQ9UGN4 299 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PRX2 142 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PSME3P61289 254 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CRMP1Q14194 572 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX30Q5JUR7 227 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6N2Q8NGY6 317 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5P3Q8WZ94 311 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PYURFQ96I23 114 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 C19orf12Q9NSK7 152 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D23Q9NUY8 699 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SPI1P17947 270 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 HACD2Q6Y1H2 254 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF148Q8N7C7 305 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 RGCCQ9H4X1 137 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCB10Q9NRK6 738 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF319Q9P2F9 582 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCD2Q9UBJ2 740 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PPH5 198 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 FABP3P05413 133 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CLUP10909 449 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PSG2P11465 335 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 FAHP16930 419 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB121Q5J5C9 76 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS45Q7RTY3 260 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 HDXQ7Z353 690 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM219Q86XT9 240 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PIFOQ8TCI5 191 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 YY1AP1Q9H869 796 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 GPM6AP51674 278 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 OR9Q2Q8NGE9 314 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8D4Q8NGM9 314 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF133Q8WVZ7 376 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD6Q9BV23 337 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS22Q9GZN4 317 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 MEGF11A6BM72 1044 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 K7EIL1 84 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 RHBDL1O75783 438 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 H2BFMP0C1H6 154 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 ACKR3P25106 362 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB13P51153 203 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 BLVRAP53004 296 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N2B8 174 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5K1Q8NHB7 308 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 HPSE2Q8WWQ2 592 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 INTS14Q96SY0 518 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TSSK6Q9BXA6 273 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CDCA4Q9BXL8 241 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SPAG4Q9NPE6 437 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TCF19Q9Y242 345 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PPE2 198 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PR64 198 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PRV1 198 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CST4P01036 141 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMG1P04279 462 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 PF4V1P10720 104 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A1P53007 311 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL31P62899 125 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM81AQ8TBF8 368 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF222Q9UK12 451 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC22O60826 627 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 DCTDP32321 178 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 THAP5Q7Z6K1 395 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00471Q8N535 108 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4M1Q8NGD0 313 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS4Y2Q8TD47 263 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 OTULINQ96BN8 352 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 GORASP2Q9H8Y8 452 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 USE1Q9NZ43 259 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNGP01579 166 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL3L1P16619 93 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVFRD-1P60508 538 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM76BQ5HYJ3 339 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SDSLQ96GA7 329 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 AMELYQ99218 206 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf21Q9H246 121 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 IL20Q9NYY1 176 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-217ENST00000629983 PITPNC1Q9UKF7 332 aa22.1■■□□□ 1.13
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