RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589537.1

NFIC-208, Transcript of nuclear factor I C, human

TSL 2

Gene NFIC, Length 977 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIC-208	ENST00000589537	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	ST8SIA4	Q92187	359 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	WDFY2	Q96P53	400 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	PRR32	B1ATL7	298 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	TTR	P02766	147 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	KRT8	P05787	483 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	OR2T7	P0C7T2	308 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	MMP9	P14780	707 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	GPM6A	P51674	278 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	CDC42	P60953	191 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	FOXL1	Q12952	345 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	OR2T27	Q8NH04	317 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	MED30	Q96HR3	178 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	CCL13	Q99616	98 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	NOX4	Q9NPH5	578 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21	2e-8	■■■■□ 20.2
NFIC-208	ENST00000589537	KPTN	Q9Y664	436 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF732	B4DXR9	585 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	HKR1	P10072	659 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	ATP6V1E1	P36543	226 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	TGM4	P49221	684 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	IL13RA1	P78552	427 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	C3orf56	Q8N813	242 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	APOL4	Q9BPW4	351 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	SIRPD	Q9H106	197 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	OR51I2	Q9H344	312 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537		A0A1B0GVI7	797 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	DLGAP1	O14490	977 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	SULT1C4	O75897	302 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	NRAS	P01111	189 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	FAH	P16930	419 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	GLRA1	P23415	457 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	CFP	P27918	469 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	CDON	Q4KMG0	1287 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	CEP78	Q5JTW2	689 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537		Q6ZSR3	168 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF573	Q86YE8	665 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	TBX15	Q96SF7	602 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	RASL12	Q9NYN1	266 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	USE1	Q9NZ43	259 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	NLK	Q9UBE8	527 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	SIGLEC5	O15389	551 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	AKR7A2	O43488	359 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	ALPL	P05186	524 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	SFTPB	P07988	381 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	MOB3C	Q70IA8	216 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	TMEM86B	Q8N661	226 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NFIC-208	ENST00000589537		V9GYS6	101 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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