RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	COPS3	Q9UNS2	423 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF732	B4DXR9	585 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	CLDN34	H7C241	214 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	AKR7A2	O43488	359 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	DHRS3	O75911	302 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	KRT8	P05787	483 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	SFTPB	P07988	381 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	HKR1	P10072	659 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	GLRA1	P23415	457 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	EPHA2	P29317	976 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ATP6V1E1	P36543	226 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	CDC42	P60953	191 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ARF6	P62330	175 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	IKZF1	Q13422	519 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	CEP78	Q5JTW2	689 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	STUM	Q69YW2	141 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	MOB3C	Q70IA8	216 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	RFK	Q969G6	155 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	APOL4	Q9BPW4	351 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393		R4GMQ9	66 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	FBN3	Q75N90	2809 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A1B0GVI7	797 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	NRAS	P01111	189 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	TTR	P02766	147 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	OR2T7	P0C7T2	308 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	FAH	P16930	419 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	IL13RA1	P78552	427 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	EFNB1	P98172	346 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	CDON	Q4KMG0	1287 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	AWAT1	Q58HT5	328 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	KRT74	Q7RTS7	529 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	OR2T27	Q8NH04	317 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	LHX4	Q969G2	390 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	SIRPD	Q9H106	197 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	NOX4	Q9NPH5	578 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	NLK	Q9UBE8	527 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	KPTN	Q9Y664	436 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	OR2AT4	A6NND4	320 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	PRR32	B1ATL7	298 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	IGLV3-1	P01715	115 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	MMP9	P14780	707 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	HTR1F	P30939	366 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	TMED1	Q13445	227 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF573	Q86YE8	665 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	SEH1L	Q96EE3	360 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	TBX5	Q99593	518 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	OR51I2	Q9H344	312 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74

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