RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 OMDQ99983 421 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 KCNS3Q9BQ31 491 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM38AQ9H6F2 299 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 RHOFQ9HBH0 211 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 VAT1LQ9HCJ6 419 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 ABCB9Q9NP78 766 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 STK38LQ9Y2H1 464 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 GLI3P10071 1580 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACACAQ13085 2346 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 ALPK3Q96L96 1907 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 FHOD3Q2V2M9 1422 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATP10AO60312 1499 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A075B6Q4 140 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A0D9SG42 100 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 RGSL1A5PLK6 1076 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 GMNCA6NCL1 334 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 CFAP73A6NFT4 308 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 K7ERS5 55 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 M0R1X1 148 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 BTN3A3O00478 584 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 SSX5O60225 188 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 FCMRO60667 390 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 VPS26AO75436 327 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 DIRAS1O95057 198 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 CTLA4P16410 223 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATF1P18846 271 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 ELK4P28324 431 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 NBL1P41271 181 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 TUFMP49411 452 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 TAS2R46P59540 309 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACTG2P63267 376 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 IFITM3Q01628 133 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 HSF2Q03933 536 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 PJVKQ0ZLH3 352 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 NAB1Q13506 487 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 TATDN3Q17R31 274 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 MFSD14CQ5VZR4 134 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 RTL4Q6ZR62 310 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 C2orf91Q6ZV80 131 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 EXOC8Q8IYI6 725 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 MS4A15Q8N5U1 240 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 WDR31Q8NA23 367 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPR26Q8NDV2 337 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR56B1Q8NGI3 324 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR4D5Q8NGN0 318 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 RHEBL1Q8TAI7 183 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 DDIT4LQ96D03 193 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 CENPOQ9BU64 300 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 TOLLIPQ9H0E2 274 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 PIGUQ9H490 435 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 NIPAL2Q9H841 368 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 RDH14Q9HBH5 336 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM9BQ9NQ34 198 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATXN10Q9UBB4 475 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 PCSK1NQ9UHG2 260 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 NUDCQ9Y266 331 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-287P-201ENST00000516230 TNIKQ9UKE5 1360 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 ALPK2Q86TB3 2170 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 MYH11P35749 1972 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A087WZY1 265 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A0U1RQV5 110 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRIM64A6NGJ6 449 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRIM64BA6NI03 449 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 PDZK1P1A8MUH7 402 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 LANCL1O43813 399 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 SOX15O60248 233 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAMP3O60896 148 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CXorf1O96002 111 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPINK1P00995 79 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 FGGP02679 453 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 HSMCR30P0CW71 290 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPX2P18283 190 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 GGT1P19440 569 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 HTR1DP28221 377 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 VHLP40337 213 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARF5P84085 180 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 RELAQ04206 551 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAPRE2Q15555 327 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 BCL2A1Q16548 175 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM27D1Q5T7N8 215 aa-0.73□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.9 ms