RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497327.1

GGPS1-208, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, human

TSL 3

Gene GGPS1, Length 868 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGPS1-208	ENST00000497327	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	POLE	Q07864	2286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	RAF1	P04049	648 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	COX5B	P10606	129 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	COX5A	P20674	150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ACHE	P22303	614 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	CCL1	P22362	96 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PAX7	P23759	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	RORC	P51449	518 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PRKX	P51817	358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PCBD1	P61457	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	KLRB1	Q12918	225 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ECH1	Q13011	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	MOG	Q16653	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327		Q499Y3	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327		Q6ZT83	130 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	NAA40	Q86UY6	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	LYPD6	Q86Y78	171 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	GFI1	Q99684	422 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ATF6B	Q99941	703 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	MMP27	Q9H306	513 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327		A0A1W2PPK0	400 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327		M0R135	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ACACB	O00763	2458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	CTDSP2	O14595	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	PRY	O14603	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	CASK	O14936	926 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	SGCE	O43556	437 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	KRT33A	O76009	404 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	SVIL	O95425	2214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	HLA-H	P01893	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	APOC1	P02654	83 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	TPO	P07202	933 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	EGR1	P18146	543 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GGPS1-208	ENST00000497327	ADRA2C	P18825	462 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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