RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 LIPKQ5VXJ0 399 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 C12orf73Q69YU5 71 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PODNL1Q6PEZ8 512 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PLET1Q6UQ28 207 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 COMTD1Q86VU5 262 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CDC20BQ86Y33 519 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 SNX29P2Q8IUI4 249 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 GID4Q8IVV7 300 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 KDM8Q8N371 416 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 OR6N1Q8NGY5 312 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TMEM163Q8TC26 289 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TMEM255BQ8WV15 326 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 SGTBQ96EQ0 304 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 OPALINQ96PE5 141 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RHNO1Q9BSD3 238 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 LINC00470Q9BZP3 86 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 HDHD2Q9H0R4 259 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 HRH4Q9H3N8 390 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TPK1Q9H3S4 243 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ANKRD19PQ9H560 264 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 NEK6Q9HC98 313 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 MALT1Q9UDY8 824 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 POU2F3Q9UKI9 436 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 AMDHD2Q9Y303 409 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 COL12A1Q99715 3063 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PTPN13Q12923 2485 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CACNA1DQ01668 2161 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TMEM129A0AVI4 362 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 DAPL1A0PJW8 107 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 OR5H1A6NKK0 313 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 IFITM10A6NMD0 228 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RIIAD1A6NNX1 92 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CENPBD1B2RD01 187 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 MS4A18H0YCH9 400 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 M0R129 80 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 M0R1B8 84 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PLPP3O14495 311 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RAMP1O60894 148 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 GPX5O75715 221 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 OR7A10O76100 309 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 SERPINA3P01011 423 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 IFNA2P01563 188 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 IGHG1P01857 330 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TFP02787 698 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RAF1P04049 648 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 KLK2P20151 261 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 C4BPBP20851 252 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PTNP21246 168 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RPL4P36578 427 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TGFBR1P36897 503 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CSNK1A1P48729 337 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 DAP3P51398 398 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CRYBA2P53672 197 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 BIDP55957 195 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TAS2R43P59537 309 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PITPNAQ00169 270 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 LTBQ06643 244 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ZP4Q12836 540 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TSPAN31Q12999 210 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 IL18Q14116 193 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TSC22D1Q15714 1073 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 GABRA6Q16445 453 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CARTPTQ16568 116 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ACKR1Q16570 336 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PCGF3Q3KNV8 242 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ALG10Q5BKT4 473 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TSPO2Q5TGU0 170 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CST9LP1Q5W188 147 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CARD17Q5XLA6 110 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 C22orf42Q6IC83 251 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 GDPD3Q7L5L3 318 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 OAFQ86UD1 273 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CCDC190Q86UF4 302 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 KLBQ86Z14 1044 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 NKAIN4Q8IVV8 208 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PHC2Q8IXK0 858 aa3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms