RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 OR3A1P47881 315 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MMP15P51511 669 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2F1Q13607 317 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ACTBL2Q562R1 376 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SPINK14Q6IE38 97 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SSX7Q7RTT5 188 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CD163Q86VB7 1156 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GALNT14Q96FL9 552 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GNRHR2Q96P88 292 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PNV4 684 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PR64 198 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PRV1 198 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2QL1A1L167 161 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SMCO3A2RU48 225 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 LIPT2A6NK58 231 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF724A8MTY0 619 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRN3E7EW58 273 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 G3V3Y1 287 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SULT2B1O00204 365 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MFNGO00587 321 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PRODHO43272 600 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 DNPH1O43598 174 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 EFNA2O43921 213 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CA11O75493 328 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1R3DO95685 299 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PMS2P2O95744 297 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HPNP05981 417 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CD14P08571 375 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SPINK2P20155 84 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GRPRP30550 384 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 IL2RGP31785 369 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL11P51671 97 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CAV3P56539 151 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ACTBP60709 375 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SELENOTP62341 195 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ACTA2P62736 377 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB1AP62820 205 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ACTG1P63261 375 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ACTG2P63267 376 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ACTC1P68032 377 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ACTA1P68133 377 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ARG2P78540 354 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 KHDC3LQ587J8 217 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ALG10Q5BKT4 473 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RAET1LQ5VY80 246 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 VHLLQ6RSH7 139 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SULF2Q8IWU5 870 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NUDT11Q96G61 164 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM100Q9NV29 134 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 DOK5Q9P104 306 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM30A4D0T7 59 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PINLYPA6NC86 204 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PLPP3O14495 311 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CTDSPLO15194 276 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNAB3O43448 404 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 WISP1O95388 367 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CTXN2P0C2S0 81 aa6.38□□□□□ -1.39
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