RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 GABRA2P47869 451 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 GSK3AP49840 483 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 RAB13P51153 203 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 GRB2P62993 217 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 SEC23BQ15437 767 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 TAF13Q15543 124 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 MYDGFQ969H8 173 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 SGK3Q96BR1 496 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 SLAMF6Q96DU3 332 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 DHRS1Q96LJ7 313 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 SIKE1Q9BRV8 207 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 FUZQ9BT04 418 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 IFT27Q9BW83 186 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 GID8Q9NWU2 228 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa11.43□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 DSCAML1Q8TD84 2053 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 PSG2P11465 335 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 RHCEP18577 417 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 GLRA1P23415 457 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 LMO1P25800 156 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC15A1P46059 708 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 RPL31P62899 125 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 DOC2BQ14184 412 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 PLA1AQ53H76 456 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 PRSS45Q7RTY3 260 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CALHM1Q8IU99 346 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 OR4X2Q8NGF9 303 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 OR2T4Q8NH00 348 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 RGCCQ9H4X1 137 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa11.42□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 TVP23AA6NH52 213 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CXCR6O00574 342 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CST4P01036 141 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 APOC1P02654 83 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 PYCR1P32322 319 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CX3CR1P49238 355 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ENTPD1P49961 510 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 PRDX4Q13162 271 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 MAPRE2Q15555 327 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 TEX30Q5JUR7 227 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CASC10Q5T4H9 136 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF626Q68DY1 528 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 TMEM200BQ69YZ2 307 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 C16orf82Q7Z2V1 217 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 PROKR2Q8NFJ6 384 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CHID1Q9BWS9 393 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CENPMQ9NSP4 180 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 NDUFAF4Q9P032 175 aa11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 SERPINA1P01009 418 aa11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 RBP4P02753 201 aa11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 SPARCP09486 303 aa11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CAPZA1P52907 286 aa11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 SSX2Q16385 188 aa11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 NKAPLQ5M9Q1 402 aa11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 LYPD4Q6UWN0 246 aa11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 THAP5Q7Z6K1 395 aa11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 OR11H6Q8NGC7 330 aa11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 HPSE2Q8WWQ2 592 aa11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 OR10A2Q9H208 303 aa11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 CMTM6Q9NX76 183 aa11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa11.4□□□□□ -0.58
PRPF40A-211ENST00000493468 DHRS12A0PJE2 317 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF850A8MQ14 1090 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 C17orf98A8MV24 154 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM90A22PA8MWA6 464 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 H0YHG0 523 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 H3BUI4 141 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 ARG1P05089 322 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 CCL3L1P16619 93 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 HSD11B1P28845 292 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 ETV3LQ6ZN32 361 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 KCTD8Q6ZWB6 473 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF561Q8N587 486 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 OR51D1Q8NGF3 324 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 OR13D1Q8NGV5 346 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 MUC7Q8TAX7 377 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 DYDC1Q8WWB3 177 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNRF4Q8WWF5 429 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 RNF170Q96K19 258 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 RASL12Q9NYN1 266 aa11.39□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A0G2JND7 137 aa11.38□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 CHRM2P08172 466 aa11.38□□□□□ -0.59
PRPF40A-211ENST00000493468 ACKR3P25106 362 aa11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms