RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	MYL12B	O14950	172 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ALX3	O95076	343 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	NRAS	P01111	189 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	LHB	P01229	141 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	BTG1	P62324	171 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	GNG3	P63215	75 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	CARTPT	Q16568	116 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	RDH10	Q8IZV5	341 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	OR51I2	Q9H344	312 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	LRP5L	A4QPB2	252 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	RGS10	O43665	173 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	PLPP2	O43688	288 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	MT-ND2	P03891	347 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	MPZ	P25189	248 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	LMO4	P61968	165 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ODF4	Q2M2E3	257 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	WDR82	Q6UXN9	313 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	RNF7	Q9UBF6	113 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.92	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	NF1	P21359	2839 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	SRRM5	B3KS81	715 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	PTGES3L	E9PB15	166 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	WNT9B	O14905	357 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	LMX1B	O60663	402 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ZMYND11	Q15326	602 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	RNF170	Q96K19	258 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	TREM2	Q9NZC2	230 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV2-5	P01817	119 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	UBE2V2	Q15819	145 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF404	Q494X3	552 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	CEP78	Q5JTW2	689 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	SPIC	Q8N5J4	248 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	GPR148	Q8TDV2	347 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	SPSB1	Q96BD6	273 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
HCLS1-208	ENST00000487290	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF732	B4DXR9	585 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	CD5L	O43866	347 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	HEXA	P06865	529 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	IRF2	P14316	349 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	IL2RG	P31785	369 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	GZMK	P49863	264 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	GPM6A	P51674	278 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	GPR50	Q13585	617 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	SPHAR	Q15513	63 aa		13.89	□□□□□ -0.19

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