RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482232.1

GTF2I-208, Transcript of general transcription factor IIi, humanhuman

TSL 2

Gene GTF2I, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2I-208ENST00000482232 NCF4Q15080 339 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 GABRA6Q16445 453 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ASCL4Q6XD76 172 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 NDUFAF7Q7L592 441 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 SPATA24Q86W54 205 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 PRELID2Q8N945 189 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ECSITQ9BQ95 431 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 FBXL12Q9NXK8 326 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 TREM2Q9NZC2 230 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 CTSFQ9UBX1 484 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 CD300AQ9UGN4 299 aa3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ZGRF1Q86YA3 2104 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 A0A0G2JRQ6 117 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 A0A1B0GW55 424 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 A6NIZ1 184 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 CENPXA8MT69 81 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 PLPP1O14494 284 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 E2F6O75461 281 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 CLDN11O75508 207 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 SEMG1P04279 462 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 STSP08842 583 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 CTRB1P17538 263 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 CXCR2P25025 360 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 NTSP30990 170 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 DEKP35659 375 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 SLC26A3P40879 764 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 OR3A4PP47883 348 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 MAP3K7CLP57077 242 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 RAP1BP61224 184 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 TPM4P67936 248 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ART3Q13508 389 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 GATSQ8NAP1 163 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 OR5K2Q8NHB8 316 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 CLHC1Q8NHS4 586 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 CACNG8Q8WXS5 425 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ITCHQ96J02 903 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 CHID1Q9BWS9 393 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ASB7Q9H672 318 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ACP6Q9NPH0 428 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 DUX4Q9UBX2 424 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 LGALS13Q9UHV8 139 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 GNPTGQ9UJJ9 305 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF229Q9UJW7 825 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ING4Q9UNL4 249 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 C15orf41Q9Y2V0 281 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 CDH10Q9Y6N8 788 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 CACNA1CQ13936 2221 aa3.55□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ENTPD5O75356 428 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 SMC2O95347 1197 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF250P15622 560 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 IGLL1P15814 213 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 OR1E1P30953 314 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 SPAM1P38567 509 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ATP6V0D1P61421 351 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 BCL2L1Q07817 233 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 COTL1Q14019 142 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 CST6Q15828 149 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 AANATQ16613 207 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 IL34Q6ZMJ4 242 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 TPGS1Q6ZTW0 290 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF546Q86UE3 836 aa3.54□□□□□ -1.84
GTF2I-208ENST00000482232 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms