RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466274.1

NCL-208, Transcript of nucleolin, human

TSL 2

Gene NCL, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCL-208	ENST00000466274	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	LRRC29	Q8WV35	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	USE1	Q9NZ43	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	C5orf58	C9J3I9	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	DEDD	O75618	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	OR2F2	O95006	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	SPN	P16150	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	S100A3	P33764	101 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	SERPINB5	P36952	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	ENTPD1	P49961	510 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	CDH12	P55289	794 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	DSTN	P60981	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	EMX2	Q04743	252 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	FMOD	Q06828	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	AQP6	Q13520	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	CASP8	Q14790	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274		Q6ZWC4	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	OR8S1	Q8NH09	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	TESC	Q96BS2	214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	GON7	Q9BXV9	100 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	WDR76	Q9H967	626 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68	3e-76	■□□□□ 9.1
NCL-208	ENST00000466274	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	GGT3P	A6NGU5	568 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274		A6NIZ1	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274		H3BSH0	61 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	CCRL2	O00421	344 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	IMPA2	O14732	288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	SAP30	O75446	220 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	TIPRL	O75663	272 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	CPA3	P15088	417 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	PTMS	P20962	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	LINC00205	P59089	165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	RAP1B	P61224	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	RAP1A	P62834	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	FHL3	Q13643	280 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	MAPK11	Q15759	364 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	DGUOK	Q16854	277 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	STUM	Q69YW2	141 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NCL-208	ENST00000466274	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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