RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF24P17028 368 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 GMFBP60983 142 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPEM2Q0P670 501 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 IP6K3Q96PC2 410 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 TM2D1Q9BX74 207 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 PECRQ9BY49 303 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 FN3KRPQ9HA64 309 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 C9orf170A2RU37 121 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 CBX5P45973 191 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ACTBL2Q562R1 376 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 TUSC5Q8IXB3 177 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR5M8Q8NGP6 311 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 MARCH1Q8TCQ1 289 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPSB1Q96BD6 273 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC7A10Q9NS82 523 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCNN3Q9UGI6 736 aa22■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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PLEKHF1-201ENST00000436066 SYNGR4O95473 234 aa21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPP3CBP16298 524 aa21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 AKR1C4P17516 323 aa21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 CPT2P23786 658 aa21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 IL13RA1P78552 427 aa21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 VAX1Q5SQQ9 334 aa21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 HOGA1Q86XE5 327 aa21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM117AQ9C073 453 aa21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 CALHM2Q9HA72 323 aa21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 IL2RAP01589 272 aa21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 S100A11P31949 105 aa21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 IKZF1Q13422 519 aa21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
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PLEKHF1-201ENST00000436066 TERB2Q8NHR7 220 aa21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 KNTC1P50748 2209 aa21.98■■□□□ 1.11
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PLEKHF1-201ENST00000436066 AMY2BP19961 511 aa21.98■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 VAMP1P23763 118 aa21.98■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR3A3P47888 321 aa21.98■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa21.98■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 C9orf135Q5VTT2 229 aa21.98■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMUB2Q71RG4 321 aa21.98■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARRDC1Q8N5I2 433 aa21.98■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR5H2Q8NGV7 314 aa21.98■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAHD2AQ96GK7 314 aa21.98■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 PARPBPQ9NWS1 579 aa21.98■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 LINC00862A6NCI5 91 aa21.97■■□□□ 1.11
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PLEKHF1-201ENST00000436066 EFSO43281 561 aa21.97■■□□□ 1.11
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PLEKHF1-201ENST00000436066 MEOX1P50221 254 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF92Q03936 586 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 FNDC9Q8TBE3 224 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 MITD1Q8WV92 249 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ST8SIA4Q92187 359 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRRG4Q9BZD6 226 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 LINC00470Q9BZP3 86 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF391Q9UJN7 358 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR6C65A6NJZ3 312 aa21.97■■□□□ 1.11
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PLEKHF1-201ENST00000436066 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRKACBP22694 351 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARF1P84077 181 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 NRN1LQ496H8 165 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 LPCAT3Q6P1A2 487 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 C3P1Q6ZMU1 363 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 CASTOR1Q8WTX7 329 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARL6Q9H0F7 186 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 METTL9Q9H1A3 318 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 RGCCQ9H4X1 137 aa21.97■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa21.96■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa21.96■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 SERPINE3A8MV23 424 aa21.96■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 NRASP01111 189 aa21.96■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM3AP98173 230 aa21.96■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 CLLU1Q5K131 121 aa21.96■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAFIPQ8WZ33 124 aa21.96■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 BORCS8Q96FH0 119 aa21.96■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 PHB2Q99623 299 aa21.96■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDCD10Q9BUL8 212 aa21.96■■□□□ 1.11
PLEKHF1-201ENST00000436066 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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