RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC22A24Q8N4F4 322 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TCP11L2Q8N4U5 519 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR5D14Q8NGL3 314 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR9A1PQ8NGU1 263 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RFESDQ8TAC1 157 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HSPBAP1Q96EW2 488 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NSMCE3Q96MG7 304 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RASL11BQ9BPW5 248 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NTMT1Q9BV86 223 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRC3Q9BY71 257 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZWILCHQ9H900 591 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNX15Q9NRS6 342 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM38BQ9NVV0 291 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAS2R13Q9NYV9 303 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NINJ2Q9NZG7 142 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNK6Q9Y257 313 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CMAHPQ9Y471 501 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa-4.53□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCN11AQ9UI33 1791 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAPKBP1O60336 1514 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A0X1KG70 313 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GAGE12BA1L429 117 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GAGE12HA6NDE8 117 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GGT3PA6NGU5 568 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C16orf97H3BN30 126 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MKRN2OSH3BPM6 223 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H3BQ85 93 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PES1O00541 588 aaKnown RBP-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR7A17O14581 309 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DENRO43583 198 aaKnown RBP-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GAGE7O76087 117 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NRASP01111 189 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GAGE12FP0CL80 117 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GAGE12GP0CL81 117 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GAGE12IP0CL82 117 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYL4P12829 197 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HLA-EP13747 358 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TIMP2P16035 220 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PORP16435 677 aaPredicted RBP-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TBXA2RP21731 343 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IMPA1P29218 277 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CASP1P29466 404 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GGT2P36268 569 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STT3AP46977 705 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCNG1P51959 295 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BLVRAP53004 296 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LIM2P55344 173 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CAV3P56539 151 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPP30P78346 268 aaKnown RBP-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RHOGP84095 191 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GAGE2BQ13066 116 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCGB2A2Q13296 93 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMED1Q13445 227 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MELKQ14680 651 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MFSD13AQ14CX5 517 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBE2SQ16763 222 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM209BQ5JX69 171 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM209AQ5JX71 171 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SDHAF4Q5VUM1 108 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IZUMO3Q5VZ72 239 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLPP4Q5VZY2 271 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GAGE2AQ6NT46 116 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LYZL1Q6UWQ5 148 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM159AQ6UWV7 190 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LMBR1LQ6UX01 489 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LYZL2Q7Z4W2 148 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKRD37Q7Z713 158 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKRD23Q86SG2 305 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUMF2Q8NBJ7 301 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR51G1Q8NGK1 321 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR52I1Q8NGK6 324 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MOSPD2Q8NHP6 518 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PFN4Q8NHR9 129 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FNDC9Q8TBE3 224 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CALML4Q96GE6 196 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMX3Q96JJ7 454 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM210BQ96KR6 192 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FCRL1Q96LA6 429 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SGK494Q96LW2 274 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC6A18Q96N87 628 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BCL7BQ9BQE9 202 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMED9Q9BVK6 235 aa-4.54□□□□□ -3.14
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSSK1BQ9BXA7 367 aa-4.54□□□□□ -3.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms