RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 OR4C45A6NMZ5 311 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 TXNL1O43396 289 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 CLN5O75503 358 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 ALOX5APP20292 161 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 PSMB6P28072 239 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 F2RL1P55085 397 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 SPINK14Q6IE38 97 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 GPR148Q8TDV2 347 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 PHB2Q99623 299 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 HES7Q9BYE0 225 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 PTGES2Q9H7Z7 377 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 VSIG4Q9Y279 399 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 BIDP55957 195 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 ODF4Q2M2E3 257 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 OR10K2Q6IF99 312 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 MCHR2Q969V1 340 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 ALKBH4Q9NXW9 302 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 MGAQ8IWI9 3026 aa16.37■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 C9orf170A2RU37 121 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 SLC17A2O00624 439 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 CYB5AP00167 134 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 CRHP06850 196 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 ITGA5P08648 1049 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 ZP4Q12836 540 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 MFAP5Q13361 173 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 RAET1LQ5VY80 246 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 OR10AC1Q8NH08 325 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 SMIM8Q96KF7 97 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 INTS14Q96SY0 518 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 KCNK17Q96T54 332 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 SLC6A7Q99884 636 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 KCNK15Q9H427 330 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 DLL3Q9NYJ7 618 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 RTTNQ86VV8 2226 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 A0A0B4J2A0 478 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 CD5P06127 495 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 HGFACQ04756 655 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 PPP1R1AQ13522 171 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 DCUN1D4Q92564 292 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 SGK3Q96BR1 496 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 FBXO17Q96EF6 278 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 SGCZQ96LD1 299 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 HRH4Q9H3N8 390 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 SLC2A8Q9NY64 477 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 KLHL13Q9P2N7 655 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 SHPKQ9UHJ6 478 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 CSAG2Q9Y5P2 127 aa16.36■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 TMEM212A6NML5 194 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 NPIPA5E9PKD4 350 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 MFNGO00587 321 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 KCNAB3O43448 404 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 DOK2O60496 412 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 OR8U8P0C7N1 319 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 SLC6A9P48067 706 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 CYB561P49447 251 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 NKPD1Q17RQ9 610 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 Q3ZCU0 254 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 OR2B11Q5JQS5 317 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 OR2G2Q8NGZ5 317 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 OTOSQ8NHW6 89 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 UCN2Q96RP3 112 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 CST11Q9H112 138 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 IKZF2Q9UKS7 526 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 NPIPA1Q9UND3 350 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 LRRC3CA6NJW4 275 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 P04436 131 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 SPARCP09486 303 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 CPT2P23786 658 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 MEF2DQ14814 521 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 FAM166AQ6J272 317 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 LINC00696Q6ZRV3 163 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 LINC00346Q8IVM7 164 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 OR51A4Q8NGJ6 313 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 THRSPQ92748 146 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 FAHD2AQ96GK7 314 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 MICU1Q9BPX6 476 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 TUBA4BQ9H853 241 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 PTPRBP23467 1997 aa16.35■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 SPTBN2O15020 2390 aa16.34■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 LIPCP11150 499 aa16.34■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 CD82P27701 267 aa16.34■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 CARD17Q5XLA6 110 aa16.34■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 PRSS35Q8N3Z0 413 aa16.34■□□□□ 0.21
SNX11-201ENST00000359238 ZDHHC22Q8N966 263 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms