RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 A1L4Q6 167 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5B21A6NL26 309 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 A6NNC1 897 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC17A2O00624 439 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM127O75204 238 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 EVX1P49640 407 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 MZT1Q08AG7 82 aa23.41■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR6M1Q8NGM8 313 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF671Q8TAW3 534 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 HTR2CP28335 458 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPM6AP51674 278 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNG3P63215 75 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 MZT2AQ6P582 158 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXL14Q8N1E6 418 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 HPSE2Q8WWQ2 592 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACOT12Q8WYK0 555 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 STEAP1Q9UHE8 339 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF732B4DXR9 585 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMP15P51511 669 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 RFT1Q96AA3 541 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRI1Q9BV20 369 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNTD2Q9H8S5 307 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 C14orf119Q9NWQ9 140 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 FLNCQ14315 2725 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF81P51508 661 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf100Q5SVJ3 147 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q6ZR03 302 aa23.38■■□□□ 1.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10AD1Q8NGE0 317 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXW5Q969U6 566 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXXC4Q9H2H0 198 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMP27Q9H306 513 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 PQLC2LA1A4F0 135 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 B9A039 149 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLDN1O95832 211 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD37P11049 281 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 COX6B1P14854 86 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALDH3B1P43353 468 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 RIN1Q13671 783 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 S100A13Q99584 98 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIN7BQ9HAP6 207 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAIMQ9NVQ4 179 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABRACLQ9P1F3 81 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 A3GALT2U3KPV4 340 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 H0YL77 283 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 M0R233 179 aa23.37■■□□□ 1.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 P2RY14Q15391 338 aa23.37■■□□□ 1.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ANGPTL5Q86XS5 388 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF573Q86YE8 665 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 MUC15Q8N387 334 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 DYNLRB1Q9NP97 96 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A075B6Q4 140 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPRY3O43610 288 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLPXO76031 633 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFSF4P23510 183 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 THBS2P35442 1172 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 POU3F4P49335 361 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4D6Q8NGJ1 314 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5D18Q8NGL1 313 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELMOD3Q96FG2 381 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 COMMD3Q9UBI1 195 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GWJ7 208 aa23.35■■□□□ 1.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HS3ST1O14792 307 aa23.35■■□□□ 1.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM225BP0DP42 221 aa23.35■■□□□ 1.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ARSBP15848 533 aa23.35■■□□□ 1.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HAAOP46952 286 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR3A4PP47883 348 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 LYPD6Q86Y78 171 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMURF1Q9HCE7 757 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 F5H5P2 479 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYB5AP00167 134 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLATP00750 562 aa23.34■■□□□ 1.33
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