RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295767.9

CHCHD4-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHCHD4, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-201ENST00000295767 NDUFS7O75251 213 aa23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 RAB3AP20336 220 aa23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 HSD17B12Q53GQ0 312 aa23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 C22orf42Q6IC83 251 aa23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 DECR2Q9NUI1 292 aa23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 C14orf119Q9NWQ9 140 aa23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 FOXJ3Q9UPW0 622 aa23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 POLQO75417 2590 aa23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 HPXP02790 462 aa23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 SRP9P49458 86 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 PPP3R1P63098 170 aa23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 SAP30LQ9HAJ7 183 aa23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 EDARQ9UNE0 448 aa23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 SLC7A11Q9UPY5 501 aa23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 PQLC2LA1A4F0 135 aa23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 OR5B21A6NL26 309 aa23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF732B4DXR9 585 aa23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 ARL6IP5O75915 188 aa23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 ALX3O95076 343 aa23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 CALRP27797 417 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 GNG3P63215 75 aa23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 SPSB1Q96BD6 273 aa23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 EGLN1Q9GZT9 426 aa23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 FUT6P51993 359 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 MZT1Q08AG7 82 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 TESK1Q15569 626 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 SATL1Q86VE3 508 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 AIREO43918 545 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 LY6HO94772 140 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 MAS1P04201 325 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 GRPP07492 148 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 SRMP19623 302 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 PRKACBP22694 351 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF154Q13106 437 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 DNAAF1Q8NEP3 725 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 BORCS8Q96FH0 119 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 SPACA5Q96QH8 159 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 CENPOQ9BU64 300 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 TCF7L1Q9HCS4 588 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 TMEM138Q9NPI0 162 aa23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 TMEM210A6NLX4 147 aa23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 HCKP08631 526 aa23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 TNFRSF1AP19438 455 aa23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 DNASE1P24855 282 aa23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 MPPED2Q15777 294 aa23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM76BQ5HYJ3 339 aa23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 GPR107Q5VW38 600 aa23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 RNF144BQ7Z419 303 aa23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 RNF167Q9H6Y7 350 aa23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 BDKRB2P30411 391 aa23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 OR52N4Q8NGI2 321 aa23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 UFSP2Q9NUQ7 469 aa23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 ARID1AO14497 2285 aa23.46■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 ITPR2Q14571 2701 aa23.45■■□□□ 1.35
CHCHD4-201ENST00000295767 SHISA3A0PJX4 238 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 IGHV4-39P01824 125 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 PAX1P15863 534 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 GATA4P43694 442 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 PTH2RP49190 550 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 RBP2P50120 134 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 EFNA4P52798 201 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 LRRTM1Q86UE6 522 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 MOGAT3Q86VF5 341 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 OR51I2Q9H344 312 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 GCM1Q9NP62 436 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 CSMD2Q7Z408 3487 aa23.45■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 LRP5LA4QPB2 252 aa23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 F12P00748 615 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 ADRA2CP18825 462 aa23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 RBMXP38159 391 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 LSM3P62310 102 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 BLMHQ13867 455 aa23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 DDI2Q5TDH0 399 aa23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 CRIP3Q6Q6R5 217 aa23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa23.44■■□□□ 1.34
CHCHD4-201ENST00000295767 PERPQ96FX8 193 aa23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms