RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 CACFD1Q9UGQ2 172 aa13.13□□□□□ -0.31
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SYP-201ENST00000263233 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
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SYP-201ENST00000263233 C5orf52A6NGY3 159 aa13.09□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 DHRS7CA6NNS2 312 aa13.09□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 GLAP06280 429 aa13.09□□□□□ -0.31
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