RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 BCORP1Q8N888 145 aa14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 ARRDC3Q96B67 414 aa14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 PLSCR5A0PG75 271 aa14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 C4orf45Q96LM5 186 aa14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 RAB40CQ96S21 281 aa14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 GDF1P27539 372 aa14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 THEM4Q5T1C6 240 aa14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 M1APQ8TC57 530 aa14.43□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 IGLV3-25P01717 112 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 DDA1Q9BW61 102 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 HSF4Q9ULV5 492 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 ZNF253O75346 499 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 DRD1P21728 446 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 TDHQ8IZJ6 230 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 HHIPQ96QV1 700 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 TNFSF4P23510 183 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 EMDP50402 254 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 TAS2R60P59551 318 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 NAAAQ02083 359 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 CHST6Q9GZX3 395 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 NAA60Q9H7X0 242 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 HPP00738 406 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 SLC25A1P53007 311 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 LRP12Q9Y561 859 aa14.42□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 M0R135 149 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 M0R2Z0 102 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 ADAM20O43506 726 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 SOX15O60248 233 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 SEMG1P04279 462 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 P2RY1P47900 373 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 ZNF799Q96GE5 643 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 FGF17O60258 216 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 METRNLQ641Q3 311 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 IDSB3KWA1 339 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 IRS1P35568 1242 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 PPOXP50336 477 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 GGACTQ9BVM4 153 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 TREM2Q9NZC2 230 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 LAT2Q9GZY6 243 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 LEMD1Q68G75 181 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 OR4A47Q6IF82 309 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.41□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 FGF2P09038 288 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 OR5AL1P0C617 328 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 CDC20BQ86Y33 519 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 OR2D3Q8NGH3 330 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 RDH5Q92781 318 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 NAGKQ9UJ70 344 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 A6NDN8 102 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 FBP1P09467 338 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 Q1RN00 199 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 CD82P27701 267 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 OR3A1P47881 315 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 OSR2Q8N2R0 312 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 LINC00587B1AMM8 73 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 OGG1O15527 345 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 IL24Q13007 206 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 TP53RKQ96S44 253 aa14.4□□□□□ -0.1
CTIF-201ENST00000256413 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms